南大洋，被称为大洋之心的海域深处。
与海水几乎融为一体的“龙宫”在深海基地的外缘范围绕行着。如不是亲眼所见，“龙宫”上的全体人员绝不会相信在这样数千米之深的海底之下，竟然有着一座散发着光和热的海底之城。在一定意义上，这一由数量众多的建筑群组成的深海基地比“龙宫”更像古代神话故事中的龙宫，但那里面居住的并非可以呼云唤雨造福苍生的龙王，而是一个无恶不作，名为“命运”的魔头。
深海基地的所有建筑都处在一个呈“山”字形的超大型的穹顶之下，淡紫色的光辉如帘幕般洒下，将整个深海基地笼罩在一个宁静的圆形光幕当中。这个巨大的穹顶护罩实际上并非实体，而是一种由精密技术所构建出的平衡力场，可将护罩内与护罩外的海水压强维系在一个稳定安全的状态，确保深海基地的每一栋建筑都能安然无恙地矗立在海底当中。复杂有序的交通网络成为连贯深海基地建筑之间的唯一途径，机器人与各种交通载具忙碌地穿行在道路之上，进行着各自的工作，要想在深海之下生存并有序地进行一定的生产活动，大量稳定的物资补给是必不可缺的基础，可以预想这些具有在深海压强下工作技术的机器人及载具一定是维系整座基地运转和人员生活的关键所在，它们维系着一条从陆地到海底的生命线。
真龙与暗龙对于浮冰组织是否能建成这堪称为工程学奇迹的深海基地仍抱有怀疑态度，但显而易见的是，有着时间之门在幕后暗暗支持的浮冰组织，确实有着颠覆世界的可怕实力。试想一个藏在深海之下进行着不可告人阴谋的神秘组织，只是想想也已经教人头痛，如没有ECCO与真龙、暗龙这样的强强联合，想要彻底消灭它几乎是不可能的。
“龙宫”的作战指挥中心里，真龙与暗龙的所有核心成员都已经集结一处。
当黑天带领着来自浮空城堡的一支暗龙团队登舰后，所有参与对浮冰组织最后一战的成员已经全部到齐。黑天的到来并没有在“龙宫”上造成多大的震动，能有这样一个强有力的友军在身边已经是很幸运的事情，没人敢再奢求其它，更何况在利益之下敌我关系是动态变化的，只要仍有着共同的利益，真龙与暗龙就还是一个战线上的“朋友”。
真龙与暗龙的今次合作，并非只是晨曦与黑天略显苍白的口头约定，双方仍是进行着互利的行动以示诚意。真龙作为中间协调人，促使ECCO停止了对暗龙的监视与打击，而暗龙不仅让星月与阿里达两大龙魂战士无条件地遵从真龙的指示行动，更让浮空城堡上的一队工程师暂时加入到“龙宫”的后勤队伍中，帮助真龙提升“龙宫”的武器和防御系统。由于浮空城堡与“龙宫”都是星雅人硕果仅存的遗产之一，两者的技术有许多共同之处，因此这些暗龙工程师们的到来尤为重要，有了他们的技术支持，相当于变相地提升了“龙宫”原先的实力。而暗龙与真龙约定合作中的另一条件，对织田美嘉来说无疑是一个好消息，黑天向真龙承诺，一旦此次合作能令他得到想要的东西，他将无条件地将自己的父亲织田真刚放回真龙，尽管黑天仍希望手握这一重要人质令真龙有所顾忌，但这至少是一个好的开始，成为了织田父女团聚的契机。
韩梅，卫子秦，叶列娜所带领的一支由两百人组成的精英突击队正在“龙宫”的军械库里进行着战斗前的最后准备（伊凡诺夫因荒镇之战伤势过重，仍在养伤）。这支队伍里半数以上的人均是由世界各地的ECCO分部抽调来的未来战士，配备着各种型号的作战机甲，他们相当于一个强大的移动军火库，可胜任任何恶劣环境下的作战。队伍中的其他人则是特种部队中的精英，专门进行渗透，爆破，侦查等特别行动，一旦攻击队伍就位后，他们将竭尽全力地确保登陆区域的安全，为后续到来的进攻部队尽可能地创造良好条件。这支精英突击队将跟随真龙和暗龙的主力一起行动，直扑浮冰组织位于深海基地的核心要害。
“这里是深海舰队的伦纳多将军，‘龙宫’的各位，你们现在的情况如何？”
波天野一边发出命令示意真龙的工作人员继续维持“龙宫”的正常运转，一边回复道：“收到，深海舰队，这里是‘龙宫’。伦纳多将军，请让你的舰队暂停行动，维持在安全区域活动，一切行动以‘龙宫’发出的行动指令为准。”波天野是此次进攻行动中的协调专员，并拥有着在攻击行动开始前的一切指挥权，责任重大，他所下的每一个命令都将直接影响着对深海基地攻击行动的成败。
“好吧，我会遵照‘龙宫’的指令行事。请记住，无论如何一定要想尽办法来削弱深海基地外围的防御，不然深海舰队很难对敌人造成有效的打击。”伦纳多将军回复道。ECCO的深海舰队是由战斗潜艇与深海运输潜艇组成的混编舰队，一旦战斗打响，它们将以远程火力为登陆部队提供必要的支持，并尽可能地摧毁深海基地外围的一切防御，但深海舰队并不具备“龙宫”出色的隐匿能力与缠战能力，一旦被敌人所探测到，它们将很难躲过敌人绵密的炮火打击。
波天野再度发出新的指令，“龙宫”结束了在深海基地外缘的徘徊，进入基地内的警戒范围。此时的“龙宫”早已不是星雅人文明后期的那艘两栖超级战舰了，自从ECCO占据环形高塔并恢复了这艘战舰的运转后，在学习星雅人在战舰上科技的同时，也将当代先进的武器技术引入其中，两种截然不同的武器系统本不可能兼容使用，但晨曦来自星雅人方面的知识，加上波天野超脑系统的整合，终于让“龙宫”成功变为综合了星雅人科技与当代科技的超级产物。其中，以融合了星雅人激光科技和ECCO改良调校后的等离子科技的集束重炮最为引入注目，它在“龙宫”启程的前一天完成调试并成功搭载，成为进攻深海基地的一大利器，相当于将ECCO引以为傲的等离子聚能炮的超级加强版带入海底。
保持着隐匿状态下的“龙宫”，将其散布的热能全聚集在装甲下，之后在由能源核心的调节网络传输给舰船里的各大系统进行使用，这种循环技术虽然无法避免能量的衰减，但却将资源循环发挥至极限，而且可避免因为散热而被敌人的侦查设备所捕捉到。漆黑的海底里，如镜片一样反射着透明流光的“龙宫”就这样悄无声息地深入至深海基地的近侧位置，开启传感器开始收集基地周边的防御数据，并将之传给深海舰队。
深海基地的防御网络远超出原先的估计。从“龙宫”的探测网络上反馈回的数据在作战指挥中心的传感地图上呈现出深红一片，这表明深海基地的穹顶护罩周边范围的地底内存在数量众多的高热能的目标，虽然“龙宫”无法传回实时图像，但通过先进的探测技术，炮台和飞弹发射装置的全息模型仍被清晰地记录在“龙宫”的作战系统中，由于波天野将超脑系统接入到“龙宫”的作战系统网络中，因此身处作战指挥中心的众人得以感同身受地观看到“龙宫”处理敌方防御武器数据的直观过程。
“开始散步电磁粒子。”波天野开始进行下一步的行动。
所谓的电磁粒子，是一种具有电磁干扰的微型附着颗粒，能自发地被拥有电路设备的仪器所吸引，并在附着其表面之后，颗粒内部的干扰物质开始渗透进仪器当中，达到破坏及干扰的作用。电磁粒子本是ECCO正研发的一种原型兵器，但因为使用电磁粒子的载具均没有良好的隔离效果，因此在释放电磁粒子时，自身也不可避免的受到干扰，但“龙宫”表面的护盾则完全不受影响，星雅人在杜绝电磁干扰的水平上比现时的人类要先进许多，因此“龙宫”自然而然的成为了唯一配备电磁粒子的舰船。电磁粒子随着海水飘落，并渗透进海底的泥土层，埋藏其中的防御武器立时受到不少的干扰，“龙宫”通过这样隐蔽的方式尽可能地对深海基地的防御武器造成一定的影响，以减轻ECCO深海舰队进攻时的压力。果然被电磁粒子所覆盖后的区域，在全息地图上的热感等级均大大降低，这意味着一旦到使用阶段时，这些防御武器的使用效率也会大幅降低。
在深海的极大压强下，战场环境及其恶劣，因此浮冰组织全靠地基的防御武器来进行基地周边的守护工作，而ECCO和真龙则务求一击必中的战术打击。双方直至现在都仍未爆发激烈的交火，但无声的战争已经在悄然进行着。“龙宫”并未深入至穹顶护罩附近，因为从穹顶护罩的表面探测到很强的能量反应，这很可能是浮冰组织用于探测外来敌人的一层防护，当突破穹顶护罩的同时，也就是总攻开始的时刻了。
为了确保进攻行动的顺利，减少暴露的可能，“龙宫”决定停止散步电磁粒子，先行返回预定位置与深海舰队会合再发起攻击，正当即将越过横亘前方的深邃海沟时，异变突生。“龙宫”上的侦测数据变得混乱起来，一些原本正在高效运行的探测仪器竟陷入失灵状态，更让人担心的是，他们与ECCO最高指挥部所在的环形高塔以及深海舰队的伦纳多将军都失去了联系。
舰桥上，真龙的工作人员不断反馈回“龙宫”的异常状况，而波天野也正以超脑系统搜索着“龙宫”内可能出现的问题。在进攻即将开始前的关键时候遭遇变故，令所有人的心头都泛起不安的感觉。
就在这时，黑天与晨曦脸色一变，相互对视。作为拥有时之力的门之使者，他们两人对门之力量的感应是非常灵敏的，他们同时捕捉到一股不安的源头，即一个拥有着强大门之力量的物体正在快速地向“龙宫”所在的位置接近着。
黑天厉声道：“快检查‘龙宫’的近距离传感设备，有什么东西正在接近着！”
波天野脸色凝重地摇头道：“这不可能，我们的监视网络一直在全面运作，没什么东西能在这样的情况下靠近我们的安全范围内。”
舰桥上的成员们纷纷惊呼起来，在众人诧异的目光之下，两盏犹如在黑暗的海水里摇曳的黄色灯笼忽明忽灭，但光亮却越来越大。当众人意识到这怪异的现象很可能是有什么东西在快速接近时，整个“龙宫”遭到剧烈的撞击，变得摇晃不定起来。
“龙宫”的隐匿表层因突如其来的撞击而消失，行踪暴露。但真正令真龙和暗龙担心的，并非是此时已经锁定了“龙宫”的炮台与飞弹，而是那名突然施袭的不速之客，它那独特的形体特征真龙等人并不感到陌生，即便是初次见到它的人也很快会在脑海中留下深刻的印象。两只灯笼般摇曳着绽放黄色异芒的大眼，形似章鱼般粗壮有力的触手，表层皮肤上怪异的纹络与凹凸不平的疙瘩状物体，这只充盈着爆炸性力量的巨兽，正是当时出现在谜海海域上，追逐着真龙一行的狂怒海兽。在环形高塔的空间波动被真龙消除后，狂怒海兽也随之失去了踪迹，没想到它现在又出现在大洋之心的海底深处，并且就在浮冰组织的深海基地附近。看来狂怒海兽才是深海基地最大的“防御武器”！
海水气浪纷飞，飞弹夹带着凌厉声势朝着“龙宫”集火而至。被狂怒海兽识破伪装的“龙宫”立时身陷绝境，身处炮林弹雨之中。波天野沉着冷静地发出一个接一个的命令，在生死存亡的关头，全舰上下的人员都保持着高度专注的精力，尽全力地做好手上的工作，他们必须相信自己，相信“龙宫”这艘汇聚了古今科技为一体的超级舰船。
狂怒海兽的强大力量撞击，使得“龙宫”的表层装甲遭受了二级损害，虽然尚未达到三级损害的危险级别，但情况依然十分危险，如再遭到狂怒海兽的新一轮攻击，“龙宫”将不得不进入紧急状态。但现在仍有机会，借由狂怒海兽冲刺过头的宝贵时间，“龙宫”开始绽放出其强大的实力，就在飞射的导弹即将命中之际，“龙宫”装甲下的防御机炮立时发挥作用，凭借着命中极高的激光炮将飞弹纷纷在半空中击毁。与此同时，“龙宫”将能源核心的能量传输至战舰的机动系统上，加快了“龙宫”的机动速度，终于在第二轮飞弹打击到来之前脱出火圈，并成功进入隐匿状态。失去目标的飞弹加上被电磁粒子的干扰，准头大失，朝着远离深海基地的海面自毁式的撞击。
海水被搅动起来，猛烈的气旋冲击着“龙宫”，拥有着进化之门力量的狂怒海兽能识别得出“龙宫”的隐匿状态，且在海底速度很快。它的触手仿佛从黑暗中探出的魔爪，能悄无声息地对“龙宫”进行威胁性打击。但好在海底宽阔的环境令“龙宫”如鱼得水，总能以微弱的时间差避开狂怒海兽的致命攻击。狂怒海兽非常聪明，它知道自己在速度上比起“龙宫”仍略有差距，但对环境的适应性却远比对方要强，因此不断利用海水涌动的冲击限制“龙宫”行动，让深海基地附近的飞弹得以锁定“龙宫”。
第三轮飞弹袭来，这一次由于“龙宫”为了躲避狂怒海兽的追击，不得不重新回到深海基地附近，因此基地附近半数以上的炮台和飞弹发射器全都再向“龙宫”开火射击。波天野将超脑系统的性能发挥至最大，调动着“龙宫”的作战网络，以机炮拦截敌方导弹的同时，通过“龙宫”装甲上的表层护盾偏转了大部分的炮火，将对整艘舰船的损害降至最低。成功抵御第三波飞弹打击的“龙宫”再次获得喘息机会，采取机动规避的方式离开了深海基地防御网络打击的范围。
这时守株待兔的狂怒海兽终于再度现身，几乎所有人的反应都慢上了半拍，“龙宫”原本流畅的运作状态蓦地变得戛然而止，就好像一条在大海里遨游的鱼儿突然被卡在石缝当中，动弹不得。在黑暗难辨的海水中，凭借着“龙宫”表面上的微弱光亮，众人终于认清了自身的危机处境。“龙宫”被从上方突袭而至的狂怒海兽以全省上下的七八只触手紧紧地纠缠着，随着触手上传来的惊人力量以及狂怒海兽本身门之力量的影响，“龙宫”上的供能网络受到影响，部分区域已经失去了能源的供应，陷入瘫痪。众人心中狂叫，但此时却又偏偏无能为力，只能做好心中最坏的打算，一旦“龙宫”失去动力的支撑，船体将被狂怒海兽挤压粉碎，在如此短的时间内，他们这些逃生不及的人们大多数都将永沉海底。
波天野虽是满头大汗，但他深知此时整座舰船上下所有的生命都掌控在自己的手中，他的超脑系统仍在运行着，依然能读取“龙宫”当前的整体状态。动力系统并没有被破坏，只是受到狂怒海兽触手挤压的影响而暂时失去效能，能源核心的传输网络受到的仍可修复，武器供能依然正常，这或许是一个机会与危险并存的关键时机。想到这里，他猛地发出这个至关重要的命令：“斯卡博士，让你的工程团队撤去对护盾的供能，将能量全部提供至集束重炮上！”
扩音器里传来斯卡博士断断续续的声音：“什么......你......你疯......了吗？这会让我们的......护盾立刻失效，我们......的护甲很快会被挤压破碎......我们整艘船都会完蛋的！”
波天野大力一拍指挥台，歇斯底里地怒喊道：“没时间争论了！执行命令！”
狂怒海兽灯笼般的黄色大眼射出邪恶的异芒，从海水在它身边急促的流速，可以体现出它整体正处于一种亢奋的状态之下，它的全身力量正在不住地透过触手向那插翅难逃的猎物传达过去，很快便可将其挤压得粉身碎骨，但就在这时，猎物的两侧位置，竟诡异地探出了粗长状的物体，令它在好奇心性下，仔细观察起来。
对于“龙宫”里的所有人来说，这是赌上生命的一搏。当集束重炮成功在舰体两侧探出时，因失去能量的供应，整个舰船在没有护盾的支撑下，其护甲已经被狂怒海兽的触手挤压变形，身处舰船之内相应位置的人，已可明显的感觉到“龙宫”的变形，不出十几秒，“龙宫”便会在狂怒海兽的愤怒下断为两截。
时间定格在这危机十几秒的第八秒钟，集束重炮射出红绿交融的金黄色重型光束，两道几乎可照亮方圆数里的光柱洞穿了狂怒海兽的血肉之躯，让这只凶狠的巨兽在遍洒暗黑色血液的同时，整个巨大的躯体犹如一滩烂泥般向后倒飞而去。“龙宫”仿若重获新生的鱼儿，坚强地从石缝里挺动游出，获得了久违的自由。
狂怒海兽还没有死去，它重伤的身躯依然带动着体内的愤怒，搅动着附近激流涌动的海水，变为一道海底的漩涡龙卷，向“龙宫”发起最猛烈的攻势。但“龙宫”没有再给它第二次机会，集束重炮再一次发射，这一次光柱直接穿过了龙卷强劲的风柱，直接命中在狂怒海兽血红昏黄的大眼睛上，随着一阵剧颤血雾的爆发，这蕴含着进化之门力量的狂怒巨兽终于化为粉尘，彻底被杀死。
“伦纳多将军，这里是‘龙宫’，我命令深海舰队立即向敌人发起进攻！”
“龙宫”出现在ECCO深海舰队的进攻队形当中，冒着敌人猛烈的炮火，向深海基地发起了总攻。
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ECCO的进攻部队与浮冰组织在深海基地之间防御炮火之间的火线交锋进入了持续胶着的阶段。得益于之前“龙宫”所散步的电磁粒子影响，深海基地附近相当一部分的防御炮台和导弹发射器均受到了不同程度的影响，这让原先固若金汤的防线出现了弱点。ECCO的深海舰队在“龙宫”和环形高塔的协调之下，及时调整了火力输出的方向，成功突破了深海基地的部分防区，为下一阶段的进攻提供了有利条件。
在深海舰队中的运输潜艇趁着敌人防线被削弱并开始向深海基地发射士兵舱时，ECCO的空中运输部队也开始向深海基地垂直投放士兵舱。这些士兵舱实际上相当于一个微型的两栖载具，可自由操纵行进方向，尽管对炮火轰炸的防护能力上较为弱，但依然可抵御深海的水压，是此次作战运送士兵的最佳方式。单个士兵舱最多可容纳十名士兵，一触发着陆程序后，形如水桶圆柱状的士兵舱将立即平面展开，在节约占地空间的同时，最大化地让里面的兵员迅速行动，避免了在刚打开舱门便被炮火轰炸的缺陷。第一批次的投送相当成功，半数以上的进攻部队成功渗入穹顶护罩。穹顶护罩此时已经成为了一把对浮冰组织的双刃剑，它既可将深海的压强与深海基地隔绝开来，同时也为ECCO的地面进攻部队创造了良好的生存条件，由于缺少深海水压的影响，ECCO的地面进攻部队得以快速灵活地展开，行动迅速地直扑基地内的各个重要目标，整个进攻作战依照原先设想的发展趋势进行着。但ECCO的运气并未持续多久，浮冰组织及时调整了炮台与导弹的打击模式，敌人开始重点攻击缺少防护的士兵舱，开始削减ECCO对深海基地的冲击，如若没有地面部队的参战，与深海基地的战斗将演变为炮火对射，ECCO最终将无功而返。
就在敌人炮火开始猛烈地打击投送中的运输部队时，“龙宫”号再次发挥出其出色的隐匿能力与出色的机动力。没有了狂怒海兽的阻碍，它如入无人之境地避过炮火打击最猛烈的区域，此举相当于避开了ECCO原先的常规进攻路线，另辟蹊径地深入深海基地内围。然而在穿越穹顶护罩时，深海基地仍是发现了“龙宫”，在这样的情况下，“龙宫”争分夺秒地将韩梅带领的ECCO突击队以及真龙，暗龙等人的主要战力送入深海基地的核心之处，即代号为“坚冰”的主建筑。
经由“龙宫”的扫描和环形高塔的分析，并结合解密姬丽所提供数据盘后而得到的信息，发现“坚冰”实际上是一个复合型的大型高层建筑，其整体由数大功能区块组成。其中的港口码头区域位于最底层，用于停泊浮冰组织的大多数交通载具，应是进入“坚冰”的主要通道，这里也是ECCO地面进攻部队主要确保占领的目标，是为后续部队建立登录区域的首选之地。港口码头区域的再上一层，则是以研究区域与生活区域同时构成的中层区划，这里应是整个深海基地中最为重要的地方，也极可能是浮冰组织进行各种人类活体实验的罪恶场所，预计遭遇到的抵抗最为严重，是ECCO与浮冰组织争夺最激烈的地方。最后即是位于“坚冰”最上层的区域，这一区域在当前真龙和ECCO的任何技术侦测手段之内都没有任何信息，包括姬丽提供的数据盘也没有任何方面的提示，是整座“坚冰”最为神秘的地方，同时也很可能是最危险的地方，因为“命运”一定就在那里等待着真龙与暗龙的到来。上层区域就是真龙与暗龙的主战力与韩梅，卫子秦，叶列娜三人带领下的精英突击队即将突袭的地方，要结束这场战斗最快也是最有效的方法，就是直接将“命运”斩首，当然这也是整场战斗最艰难的地方。
轰隆炸裂声接二连三地在“坚冰”上层区域的预定地点传来，为原本沉寂的黑暗深海敲响了几记如雷鸣般的震响，仿佛已经为浮冰组织敲响了末日的警钟。进攻部队的核心力量终于成功在“坚冰”的上层区域着陆。值得一提的是，姬丽也是突击队中的一员，抱有依然坚信能说服自己义父“命运”幻想的她，决定投身这场重要的战斗，希望以行动来减轻自己与“命运”所犯下的罪行，但这只是她单纯想法下的一厢情愿，谁都知道“命运”已经迷途难返，变为一个众所不容的恶魔，只有他的死亡才可令浮冰组织彻底土崩瓦解。但姬丽依然不顾严劲等人的劝说执意加入进攻队伍当中，众人很难去劝说她，毕竟她与“命运”的父女之情并不是每个人都能理解的，她不会心甘情愿地看着“命运”就这样死去。
迎接真龙等人的是由切割者，爬行者，失心者组成的混合异形军队，这是意料之中的事情。受限于深海的环境，浮冰组织的作战人员大多都蛰伏在深海基地的建筑屋宇之内，与外部激烈的炮火交战相比，内部的战斗更加残酷，血腥。
ECCO的突击队在韩梅等三位指挥官的带领下迸发出强大的战力，身着重型作战机甲的未来战士们构筑起钢铁长城，以配备的武器与坚韧的身体防护不住地将登陆区延伸开来，韩梅和叶列娜分别指挥两支分由十人组成的未来战士小队，发挥侧袭冲击的战术，冲散了混合异形们较为密集的阵势，而卫子秦率领的特战狙击小队们此时更是大展神威，施展他们精准的爆头技术，优先射杀动作灵敏的爬行者。
除了混合异形的军队外，浮冰组织的一般作战人员及擅长精神攻击的意念战士也隐伏其中，配合混合异形阻击不断推进的突击队伍。精擅心灵精神攻击的意念战士，是战场上最令人头痛的目标，擅长精神攻击，拥有着混乱心灵能力的他们往往能在不经意间令一位经验丰富的战士做出错误的判断，以致于下一刻便惨死在混合异形的手中。黑天，晨曦带领下的龙魂战士们终于加入战圈，凭借着极为强横的实力硬生生地冲破浮冰组织的阻击。龙魂战士们的主要敌人是混合异形中实力最强的切割者与隐蔽偷袭的意念战士，加上晨曦，黑天两大使者的全力出手，真龙与暗龙以压倒性的实力令浮冰组织的敌人们付出了惨痛的代价。
众人势如破竹地突破浮冰组织布下的连环封锁，但这时整支突击队伍已因面对敌人来自四面八方的阻击而减员三十多人，战况非常激烈。为了迅速抢占有利地形，避免更大的牺牲，突击队伍在通往内部长廊的一个宽阔入口开始布置防御据点，该处视野宽广，遍及左右连通的道路，又与后边的登陆区距离不远，便于后续援军的支援，是一个防守的好地方。在龙魂战士们的帮助下，突击队的兵员迅速进行搭建哨兵炮台，布置感应地雷等一系列增强防御的准备工作，确保将这里变为一个坚固的中转站，在确保真龙与暗龙等人退路的同时，也保障后续到来的部队能迅速深入至“坚冰”上层区域的其它地方。
在建立起防御据点后，ECCO的突击队伍与真龙，暗龙的主力成员们也到了分别的时候。他们双方侧重的任务不同，ECCO的突击队已经确保登陆区的安全，基本完成了预先布置的任务，但真龙和暗龙还要继续前进，浮冰组织的罪魁祸首“命运”还在这座名为“坚冰”的建筑深处等待着他们。姬丽虽然很不情愿，但没有蓝色龙魂的她只是一个身手敏捷的普通人，若执意继续前进，只会造成其他人的负担，她现在只能寄望于心爱之人严劲仍能坚守之前对她的承诺，尽可能地保住她义父“命运”的一条性命，虽然她也知道这是很难的事情，但信守着这个可贵的希望，或许能让她们父女还能有一个见面的机会。
韩梅和叶列娜单独与余承男道别，她们两人对余承男都有着一份埋藏心底的特殊感情。对韩梅而言，两人自光辉市开始便并肩作战，可说是生死相依，对余承男的依恋与倚靠，让她慢慢萌生了对余承男的一种朦胧爱意，但她知道自己是没有机会的，因为余承男的心里已经有了丽莎，更与星月有着一种复杂难明的感情。叶列娜对余承男的懵懂之爱始于余承男对她断臂之仇的承诺，而直到她主动坦承放弃对姬丽的复仇之前，余承男依然信守承诺，正是这种坚定的气概，令她一直心仪余承男，但她和韩梅一样，保持着一名军人的理智，只能将这份爱永远地埋藏心底。
“承男，一路小心，我们等你回来。”韩梅举起手来，与余承男紧紧一握。他们两人也是生死相交的战友，不需要过多的言语，相视点头便已是尽在不言中。
“我也是一样的话，这里就交给我们了，你们放心去吧！”叶列娜微笑着道，她的机械手臂代表了一段难忘的记忆，也揭开了她与余承男之间饱含着战友与爱恋共存的深厚感情。
余承男望着叶列娜的机械手臂，又望了望正与严劲话别的姬丽，心中暗叹。他和叶列娜都已经从姬丽的恩怨中走出，因此对于无法帮姬丽实现复仇的承诺，感到颇有失落，但人总是要向前看的，姬丽，叶列娜，包括他本人都是如此。
“叶列娜，你能答应我，好好保护姬丽吗？”
“我会尽力去做的，既是为了严劲，也是为了姬丽，同时也是为了你。”
“谢谢你叶列娜，这样我就放心了！”余承男点点头，他相信叶列娜说到做到。这时另一位老战友走了过来，他又与走近身侧的卫子秦大力相拥。
“好兄弟，好好大战一场，帮助他们报仇雪恨！”卫子秦的语气激动，余承男和身边的韩梅，叶列娜都知道他言语何指。卫子秦的战友罗曼曼，肖平在神秘无名岛上时，都因为浮冰组织的缘故而牺牲，他曾矢志要为战友复仇，但现在的情况只能遗憾地让他复仇的脚步止步于此，他只能将这份为牺牲战友倾注深情的重任交给自己信赖的好友余承男了。
余承男用力回抱卫子秦，答应道：“放心吧，我不会让你失望的！”
分别的时刻终于到来，在ECCO全体战士们的敬礼致意之下，黑天，晨曦向身后的龙魂战士们点头示意，众人毅然决然地迈入深邃的廊道当中，现在他们离这场由浮冰组织所引起的风暴中心越来越近了。
