目前设有的研究机构有：造纸研究院、印刷研究院、纺织研究院、火药研究院、火器研究院、机械研究院、农业研究院、造船研究院、日用化工研究院、飞行研究院等。
“研究院”自然是刘厚起的名字。他希望能建成后世那种大规模的研究院，不过理想是丰满的，现实是骨感的。目前各大研究院大多数只有小猫两三只，最少的只挂了个牌在窝棚门口，其实里面一个研究人员也没有。
刘厚只是想先把架构搭建起来，有个奋斗目标，以后再慢慢去完善。
造纸术、印刷术、火药、肥皂（日用化工）这几样东西目前技术都已经成熟，可以开展大规模生产了。不过刘厚依然设立相应的研究院，希望他们能不断发明新的技术，新的产品。
这几个研究院也是研究人员最多的，毕竟懂这些技术的工匠现在已经有不少了。刘厚让葛玄选出其中技术精、头脑灵活，关键是有创新精神的人充任研究院的研究人员。这几间研究院的院长都是由葛玄兼任。
纺织研究院目前主要任务是研制新式的纺织机。刘厚可太记得当年英国工业革命时，新式纺织机的发明所起到的作用了。衣食住行，衣可是排在前一位的，要想解决这个老百姓首要关注的问题，就要革新纺织技术，就要有新式纺织机。
目前纺织研究院的研究人员只有两位懂的制造传统纺织机的木匠担任。蒲元兼任院长。刘厚让左慈给他们大概说了一下新式纺织机的一些概念，可惜他自己也不是学这个出身的，只是知道纺织机大概是怎么样的，具体结构一无所知，只能靠他们慢慢摸索了。
农业研究院主要任务是研究杂交水稻。提高产量和抗虫抗倒伏的性状。这个刘厚比纺织机知道得稍微多了一点点。当年看到袁隆平事迹时，还百度过杂交水稻的原理，中学生物课也学过孟德斯鸠的遗传学理论。
于是他一股脑将这些理论倒给左慈，让他去传授给一些精于农事的人。研究人员主要是几个老农，意外的是董允作为关心农事的文官，对这件事非常感兴趣，于是刘厚让他做了院长。
火药研究院与火器研究院都是由左慈任院长。刘厚并不满足黑火药，后世那些无烟火药、***什么的才是他的终极目标。左慈收了几个有文化的人作研究人员。
而火器研究院主要是研发火枪、火炮和火箭等。主要是由一些铁匠中的佼佼者担任研究员。
机械研究院、造船研究院、飞行研究院和纺织研究院一样都是蒲元兼任院长。
其中机械研究院，刘厚给的任务很多，有水力轮机、新式水车、车床、轴承、新式马车等等，随着刘厚想起什么随时加进去什么。这里集中了大量的木匠和铁匠。
造船学院和飞行学院目前还只是个空壳，除了蒲元这位院长外，就只有一块牌匾，没有一个研究员。
原因很简单，没有相关的人才。造船是东吴的强项，蜀地却没有这方面的人才。飞行更不用说了，如此匪夷所思的事情，刘厚说出来之后，根本没人相信，连宗教界资深人士左慈都认为那只是神仙手段，只存在传说中。哪里能找到擅长制造飞行道具的“人才”？
后来得刘厚解释大家才明白，刘厚要做的不过是“孔明灯”的放大加强版。话说诸葛亮为了传递军情发明了孔明灯，这个大家都知道，毕竟作为刘备集团的工匠，有些工匠还亲自参与了孔明灯的制作，对此熟悉得很。
刘厚说要做个超级大的孔明灯，就可以载着人飞上天了。大家都给这个想法吓了一跳，不过也不得不认为，原理上是可行的。孔明灯能搭载一定重量的东西升上天，那如果做一个足够大的这种东西，搭载更重的东西上天是理所当然的。
要做一个那么大的“孔明灯”，还要有足够的强度，当然不是容易的事情。刘厚能想到的就是用铁丝扎一个球形的架子，以皮革覆盖表面，皮革的接缝处再覆盖一层皮，尽量令它不漏气。
刘厚让左慈找刘备下令收集辖区所有的皮匠，甚至到魏国和东吴高薪聘请皮匠。起初刘备听说左慈要造可以带人飞上天的东西时，也觉得他是胡闹，不过当左慈将“孔明灯”展示出来时，诸葛亮立刻恍然大悟，这还是哥的原创啊！左慈你竟然抄袭哥的发明！不过对于左慈要建造一个堪比宫殿那么大的“孔明灯”，诸葛亮还是挺佩服他的气魄的。
他当然很熟悉自己发明的东西，他也意识到，这个东西足够大的话的确是可以载人飞上天的。同时还意识到，这个东西在军事上的伟大意义。诸葛亮当时就激动得全身发抖，马上建议刘备全力配合制造这东西。
来投靠的流民很多，劳动力问题是解决了，但是人才、尤其是高端人才就不是那么好解决的了。刘厚需要各行各业的人才，除了各个领域的技术人员，还有管理人员。这些都不是从流民中能得到的。虽然，流民中也有一些人才，但毕竟不多，对刘厚来说杯水车薪。
于是刘厚派出大量人手，全天下搜罗人才。刘厚搜罗人才是有针对性的，他凭着印象中，对三国这段历史的一些著名人才进行针对性的部署。
在洛阳的某处宅院，到处散落着各种木制的零件。一个三十多岁的男人淹没在这些零件当中。只见他不时组装一些零部件，有时候又拿去刀、凿、锤、锯等工具对这些零件加工起来。
一个十七、八岁的学徒模样年轻人大步走进这间屋子，递上一张拜帖，说：“师傅，有客人求见。”
“不见，不见，没见我忙着吗？别打扰我。”
“师傅，他说你看了拜帖，自然会见他。”
“喔，谁吃了大蒜那么大口气，拿来！”30多岁的男人扔下手上的凿子，伸出一只粗糙的大手。
大蒜在西汉时从西域传入中原，现在一些家境好一点的家庭是能吃到，显然，这个人也是吃过大蒜的，故而有此一说。
徒弟将拜帖塞到他手上。这是张拜帖外表很平凡，只在封面上端端正正写着“拜帖”两个字。
“哦！”但是男人一入手就惊异地叫来出声。
“这是？这不是蔡侯纸！这比蔡侯纸还好！快，快请那人进来。”男人急切地吩咐徒弟，他甚至都没打开拜帖看一眼。不过一眼就看出纸张的优劣，看来也是个识货之人。
没多久，徒弟领着一个文士打扮的人进来。“马师傅，您考虑得怎么样？”这个文士拱手向男人行了一礼直接道。
原来这个男人是魏国最著名得的大匠师、发明家、科学家，姓马名均，字德衡，历史上他曾经官至给事中。
他可是个了不起的人，曾经发明失传的指南车、翻水车、百戏木偶等，还改进积绫机器、诸葛连弩等。据说他改进的诸葛连弩可以使发箭力量增加5倍，相当惊人。他还计划造一种可以连续抛射的轮转式发石车，可惜最终没引起朝廷重视，无法立项。
马均是刘厚记得的为数不多的几个三国时期著名的科学家之一。
“喔，什么？什么考虑得怎么样？”马均根本不认识来人，对来人一来就问这么莫名其妙地问题也感到很莫名其妙。
“呃……，就是拜帖所说之事啊。”来人也有点莫名其妙，不知道问题到底出在哪里。
“喔，是这样啊。”马均尴尬地抓抓头，这才打开拜帖看起来。
拜帖的内容很简单，是说这张拜帖的主人已经制造出可以载人飞上天的物事，想邀请马均前去观看，并且共同研究重现鲁班的诸项发明。
相传鲁班有多项惊世发明，除了后世一直在使用的锯子、墨斗、曲尺等木工工具外，还有一些神乎其神的发明。这些发明包括可以在天上飞三天三夜的竹鹊、可以乘着飞上天窥探敌人城市的木鸢、可以以假乱真的木人舞姬、使用机关自动行走的木车马和木人御者，可载其母（也就是可以载人自动行走的木车）等。
这些东西放在后世都不算什么，我们都可以从现实生活中得到一一印证。例如，会飞的东西我们有飞机、无人驾驶飞机、航天飞机等；舞姬属于机器人范畴，以21世纪的机器人技术来说，弄个会跳舞的机器人不是什么难事，据说日本，已经做出样貌和人十分相像的机器人；自动行驶马车也不算什么，google的自动驾驶汽车技术据说已经十分成熟，中国也有机构在测试自己的自动驾驶汽车。
但是在古代，这些可就是了不得的东西了。一般人都相信那不过是神话传说而已，现实中怎么可能有这么精巧的东西？但是偏偏历史上的确有一些技术狂人一直在致力于复原这些“奇淫巧技”，如三国时期的马钧、晋朝的区纯、北齐的灵昭、唐朝的马待封等。马均正是这些技术狂人中的领军人物。
刘厚深知这些技术狂人的心理，他们对技术上的追求胜过一切，如果他们知道有人能复原鲁班这几项传说中的物事，可能难于抵挡诱惑跑来观看。如果能参与这些物事的研究，那更是他们的毕生心愿了。所以专门派人以这些事物引诱马均。
马均一看拜帖，果然鸡冻了。“这，这是真的吗？”
“当然是真的。”来人答道。
马均一把抓住来人的手臂，道：“你可别骗我，能载人飞上天，这可是鲁班先师的手段，几百年来无数能工巧匠试图重现这一宏愿均无法成功，你主人到底是什么人，竟有如此本事？”
“是真是假，马师傅过去一看就知道。”来人拿开马均的手，揉了揉被他抓痛的地方，道。
马均一想，对呀，真的假不了，假的真不了，说什么也没有亲眼所见重要。于是道：“贵主人在哪里？快带我去看看。”一副火急火燎的样子。
“请马师傅稍安勿躁，实不相瞒，我主人在蜀地，路途遥远。请马师傅收拾行装，安排好家里的事再跟我出发吧。”
