对诺贝尔来说，有一个重要的工作就是保护他的发明。他要亲自办理这方面的事务，特别是那些化学专利权。
19世纪80年代，欧洲国家由于政治形势，急于得到一种威力更大、冒烟更少的炸药。
诺贝尔曾从事过改进老式炸药的工作，旨在创造一种效能尽可能大的民用矿业炸药。这时他自然而然地加入到了研制无烟炸药的行列。他通过闯赛璐珞物质这条路，经过8年的研究，达到了目的。
这种赛璐珞物质由同样分量的硝化甘油和硝化棉，加上10%的樟脑构成。诺贝尔认为，将这种赛璐珞装在火器里，它就会以缓和的燃烧率进行燃烧。
如果用这种物质代替黑色火药的话，这种缓和的燃烧是有必要的，而且比黑色火药优越得多：它产生巨大的力量，却不留下任何渣滓，而且是无烟或非常接近于无烟的。此外，它还可以无限期地储存，并且价格便宜。
自1887年至1891年间，诺贝尔取得发明专利权后，把他所发明的这种无烟炸药公之于世。
早在1875年发明的爆炸胶，是硝化甘油与硝化棉的混合物，而这一次的新发明却是通过结合两种炸药制成的新型炸药；而这种新型炸药又是不会产生浓烟的，除非在密集的岩层中，用数学般的精确控制来点火燃烧。
诺贝尔向法国炸药垄断组织“炸药与硝石局”申请这项专利，但因为同政界有势力的人士关系不睦，遭到拒绝，诺贝尔只好将视线转向了其他国家。
这个时候，最重视诺贝尔发明的是意大利，意大利政府希望能与诺贝尔建立商业往来。诺贝尔欣然接受了政府的要求售货给意大利。
法国陆军司令气势凌人，说：“诺贝尔真是个危险的小人，他住在我国境内并且做起生意来，如今还想把重要的军事装备卖给其他国家。如果再不加以制止，恐怕利益将尽归他国！”他们决定要先下手为强！
向诺贝尔购买飞行炮弹的意大利政府进一步希望在国内制造这种新火药。于是要求诺贝尔出售专利权，并请教他制作方法，诺贝尔欣然应允，以50万里拉作为交换条件。
诺贝尔把火药制造法售予意大利。并建立了一个专门制造这种炸药的大型生产部，1889年签订了300吨的交货合同。
这件事当然会引发政治干预和法国人的激愤。报界对诺贝尔展开了猛烈的攻击。他被公开指控盗窃国家机密，被诬陷从垄断局炸药研究实验室里偷窃了机密。
法国陆军司令正式下令处置诺贝尔。他们决定以违反法国火药公卖法，封闭他的工厂，并将所有机械工具等一律没收。法国政府开始以如此卑下的手段对付一个对世界有伟大贡献的发明学者。
一天早上，警察突然闯入了诺贝尔工厂的实验室。
“这是怎么回事？”诺贝尔深感诧异地问道。“你违反了火药公卖法，现在我们要查封你的工厂。”警员念着查封书上的理由。
诺贝尔勃然大怒地说：“真是笑话！什么叫违反公卖法？我多年来一直从事这一行业，曾给法国带来不少利益，你们竟来封闭我的工厂，简直无理取闹！”
“你不必多费口舌，我们只是奉命行事罢了！”警察们开始动手执行任务，诺贝尔向他们提出了严厉的抗议。“这是我私人的研究室，不属于工厂任何一个部门，你们擅闯民宅，难道不怕违犯法令？”
警察对诺贝尔的抗议毫不理会。他们一拥而入，把药品、实验器具以及小型大炮通通带走。
“真是无法无天、岂有此理！随便捏造一个罪名诬告我、破坏我的工厂，火药算什么？真正会遭受重大损失的是你们法国，我也不想逗留在这种国家了！”
诺贝尔受到坐牢的威胁，实验室又被警察搜查并封闭，拥有枪炮和进行试验的许可证被吊销，工厂里正在进行的混合无烟炸药的生产也被禁止，已经制成的试验用的炸药遭到没收。
在这种情况下，诺贝尔的正常研究工作中断了，他情绪沮丧、心情沉重，决定离开这个国家。
在拜访了哥哥罗伯特，并且到阿维利亚诺、阿迪尔和克鲁梅尔的工厂进行各种安排之后，1891年，诺贝尔赶回巴黎，带着所有未被没收的实验仪器和私人财产，毅然离开了法国，迁居意大利。
诺贝尔由于无烟硝化甘油炸药，即混合无烟炸药的发明，引起了很多国家的浓厚兴趣。黄色炸药时代的老敌手阿贝尔教授也和诺贝尔成了好朋友。谁知，这却成了诺贝尔一生的遗憾。
1888年，英国政府组建了一个炸药委员会，负责调查对军用有影响的炸药。
阿贝尔教授是这个委员会的成员，他以委员会的名义与诺贝尔联系，要求他将自己的发明尽可能完整、秘密地提交给委员会。从1888年秋至1889年秋，诺贝尔先后提供了混合无烟炸药的配方、生产方法、样品的完整情报。
阿贝尔教授研究诺贝尔发明专利权的处方后认为，樟脑的挥发性太强，是一种不适宜的成分。诺贝尔随后提出了用****来作为替代物等建议。
阿贝尔又告诉他，不溶解的硝化棉比诺贝尔用的可溶硝化棉要好得多，可溶硝化棉的特性太变化无常了。
从此以后，阿贝尔不再将进一步的情况通知诺贝尔。他自己开始研究改良型炸药，最后取名为“线状无烟炸药”。
这项发明，立即在英国和其他几个国家登记了发明专利权。在英国的发明专利权移交给了国家，而在其他地方的，则作为发明者私人的财产，后来曾以可观的利润卖给了各国政府。
由于阿贝尔教授的声誉和良好关系，这项专利登记当时能够一度保密。在国家委员会的推荐下，阿贝尔使英国陆军和海军采用了线状无烟炸药，并且拥有使用它的独占权利。
当诺贝尔炸药公司取得诺贝尔的混合无烟炸药专利权后，向国防部提供其他的炸药时，阿贝尔的行径暴露了，线状无烟炸药是怎样演变出来的，也被当时的人们看清楚了。
诺贝尔公司自然把这件事看成是违背发明专利权的行径，并且提出了抗议。打算同这种身居高位、蓄意行事并且有恃无恐的对手通过“友好的诉讼”来解决问题。
1892年，诉讼案首先在平衡法院审理，1895年，被提交到上诉法院和贵族院，拖了很长时间，案件引起了轰动，英国的报刊也展开了热烈的辩论。
然而，经过大量的推断，所有的法庭都驳回了诺贝尔公司的索赔要求，并勒令其支付2.8万英镑的诉讼费。理由是在诺贝尔发明专利权的登记上，曾将配方含糊地写为“以可溶著称的那种”硝化棉成分，这被双方的证人和专家们用不同的方法进行了解释。最后，法院判决说，这种表达意味着不包括那些被认为是“不可溶解的”硝化棉在内。
但是，在案子的审理期间，诺贝尔的开创性工作也被人们普遍了解。诺贝尔也得到了精神上的补偿，当时的高等民事法官凯伊曾说过这样一段话：
在这桩案件中，我不能不对原来的发明专利权持有者表示同情。相当明显的是，一个被允许爬到巨人背上的侏儒，能够比这位巨人本身看得更远些。诺贝尔先生搞出了一项伟大的发明，这项发明在理论上是卓绝的，是一项真正伟大的发明。
之后，一位聪明的化学家得到了这项专利品的详细说明，仔细阅读之后，发现实际上可以使用同样的物质，改用其中之一，就会产生相同的效果。
遗憾的是，想从诺贝尔先生那里拿走发明专利权的价值，却是办不到的事情。
诺贝尔对这场诉讼中的法律和官僚主义进行了尖锐的评论：
对于这场官司在金钱方面的损失，我可以不去注意，但却难以抑制我的极大厌恶。
人们说，牛奶洒了，哭也没有用，这件事也是如此。但一个国家做了非常不公正的事情，却不能不使我产生憎恶的感情。
一种健康的是非观念，不应该是从民众上达于国王，而应该是从最高点向下传布才对。整个线状无烟炸药诉讼的道德，正像哈姆雷特所预示的那样：国家法律中的某些东西已经腐烂了。
