直肠指诊能发现较大的前列腺结石。结石较大时，前列腺也会增大，通过直肠指诊可扪及结石或质硬的结节。如果腺体内有多块结石，占据了腺腔大部，用手指触摸时可有结石摩擦音或捻发音。但如果结石较小或位于腺管、腺泡深部，则摸不出捻发音。前列腺结石合并前列腺炎症时，包膜增厚，指诊时易误诊为癌肿，但这种结节不固定，可活动，边缘清楚，结节间的组织正常，据此可与前列腺肿瘤区别。
可见直肠指诊能发现一部分前列腺结石，而有些结石难以发现，有些还应作鉴别诊断。因此，在做直肠指诊的同时，还应在必要时做血清学检查、X线检查甚至经会阴或直肠穿刺活检以帮助诊断。
