拖到七月中旬，王旦又一次上表请求罢去枢务；赵恒又一次在滋福殿召见王旦；这次情况明显更加糟糕。王旦没有多说什么，拿出一份准备好的名单交给皇帝，说这些人都是才堪大用，希望皇帝留意。
约摸一刻钟的样子，王旦就告退了。几天之后，赵恒下诏，免去王旦宰相职务，以太尉领玉清昭应宫使。
事情不出王旦的预料，赵恒犹豫了一个月之后，还是任命枢密使王钦若为左仆射平章事，接替王旦的职务。
接到了拜相的白麻之后，王钦若志得意满地对中书同僚说：“要不是王子明从中作梗，老夫十年前就入主中书了！”
不过，入主中书尽管已经是职业生涯的顶峰，王钦若却怎么也找不到那种呼风唤雨的感觉；他实在是很纳闷：“为什么王子明在的时候，看起来在中书政事堂里人人敬畏，一言九鼎；换做自己的时候，却常常被同僚们驳斥得很狼狈呢？”
这个谜不经意之间被王曾给揭开了。为了枢密副使张旻是否应该被罢免一事，王钦若与参知政事张知白大吵一架；张知白竟然拂袖而去。
王钦若愤愤然地对参与争执的王曾说道：“王子明在中书的时候，你们一个个的俯首帖耳，尊敬有加；现在老夫执掌中书，你们怎么连个起码的礼节都不顾了？真是岂有此理！”
王曾闻言，莞尔一笑，上前长身一揖，不无调侃地回应道：“子明相公一心忧国，鞠躬尽瘁，德馨朝野；足下岂能相提并论？而且，陛下的恩遇也相去甚远。在下初入中书时，见子明相公有时不经请旨便自行发落一些事项，很是惊异，提醒之后也不见什么效果，于是就觅一机会，将此事奏报陛下，陛下当面谕示：‘王旦事朕多年，处事公允，无丝毫私心，所以东封之后，朕许其小事可以自行斟酌决断；你们初入中书，凡事都要与王旦商议，取其裁示方可。’”
王钦若听得目瞪口呆，虽然不欢而散，心中却是恨恨不已。
机会终于来了。刚进入九月，太祖孝惠贺皇后的家人进宫抱怨说，将一座旧宅子卖给了参知政事王曾，还没有搬迁完毕，王曾就派人把翻修用的土石木料堆在门前，实在是太过分了。
赵恒听了有些不高兴，碰巧王钦若进宫奏事，就顺便征求一下他的意见，王钦若义正辞严地说：“王曾这个人在中书一向作风霸道，没想到对皇室姻亲也是这付嘴脸；如果不加以惩戒，哪里还会有什么人臣之礼呢？”这个看法与皇后的意见居然不谋而合，赵恒也觉得有理，王曾就被免去参政职务，以礼部侍郎归第。
陈彭年二月份去世了，张旻前一阵子也被免去了枢密副使，出任河阳三城节度使，因而中枢也顺势被调整了一回。翰林学士、右谏议大夫李迪擢为给事中、参知政事；颍州防御使马知节为宣徽南院使、知枢密院事；枢密副使曹利用、任中正，以及枢密直学士周起一并同知枢密院事。
王曾被罢了相，多少也有些郁闷，便想去看望一下王旦，一则探视病情，二则聊以排遣。不料，王旦家人出来说，相公病体沉重，已经不能见客了。王曾只得怅然而返。
王旦确实是已经下不了床了，房间里坐着杨亿，正在奋笔撰写遗奏。
按照王旦的本意，遗表中只叙及平生际遇，并吁请皇帝进用贤士，躬亲庶政等等。
杨亿走后，王旦又将家中子弟叫来，一一叮嘱后事，至晚才罢。几天之后，王旦去世了。
赵恒亲临丧礼，大哭一场；而后废朝三日，下诏赠王旦太师、尚书令，谥为文正；同时录用子弟侄孙、门生故吏十余人为官。
