墨莲既然已经答应了吉尔伽美什，不会插手，她便说到做到。做一个「见证者」，她会看着、会看着并且注视着所发生的一切，绝不会移开视线。
次日，来自迦勒底的一行人，立香等人便开始接受类似万事屋的各种委托：剪羊毛、驱除恶灵、士兵训练以及帮花店的老奶奶看店等……
在立香他们的功绩足够多的时候，立香被吉尔伽美什王委托前往乌尔，与玛修、梅林以及安娜一同上路在对丛林的路况开始感受厌恶时，豹人出现，在对豹人的体力以及精神感到疲惫后不久便到达乌尔。
立香一行人了解乌尔的现状后，再次遇上豹人，因为实在无法拼体力以及精神力，无奈之下只好撤退。
乌尔一事过后，立香等人接受吉尔伽美什王的另一件委托，到库撒市寻找天命的泥板。
立香等人在找到天命的泥板后遇到伊什塔尔，再怒怼伊什塔尔后遇上亡灵大军，因为战斗力拼不过，再次撤退在回到乌鲁克后再度接受守护北壁的委托，次日对战迎来的魔兽大军和金固的袭击。
立香一行人在被吉尔伽美什王委托收买伊什塔尔方面成功，伊什塔尔加入我方后，讨论改怎样解决三女神同盟之一的魁扎尔（羽蛇神）的问题时，刚好魁扎尔杀入乌鲁克来。
在魁扎尔离开后再次接受吉尔伽美什王的委托，第二次前往乌尔把魁扎尔收入麾下。
吉尔伽美什突然去世，好像是过劳死，后来发现是冥界女神埃列什基伽勒在背后操纵，在吉尔伽美什‘过劳死’之后，众人才知道埃列什基伽勒才是三女神之一。
为了带回吉尔伽美什，伊什塔尔用宝具再现了下冥界的神话，与玛修、立香一起进入冥界。
我比较希望她们能快点把吉尔伽美什带回来，吉尔伽美什‘过劳死’，还有因为吉尔伽美什‘过劳死’而慌了的西杜丽，现在所有的事情都是我一个人代替处理，我快忙不过来了，不过看目前的情况，西杜丽应该能恢复过来，来帮忙处理事情了。
现在让我们把镜头转向冥府————
埃列什基伽勒在被击败后，将自己说成了无恶不作的恶人，要众人赶快结果了自己，却被乱入的神秘老人切成两半，伊什塔尔下意识地呼喊着姐姐的名字，攻击了神秘老人。
老人解释自己只是切了三女神契约而不是生命，活生生的埃列什基伽勒这才站起来惊呼自己没死。
老人一语点破埃列什基伽勒‘作为被托付了灵魂的女神，深爱着人类’。埃列什基伽勒极力反驳，说自己钟爱的只有死之国，地上的人怎么都样无所谓。
立香回想起前几次的交谈，说你说的不对，之前说漏过嘴。埃列什基伽勒自称只爱‘死去的人类’，其实是爱着‘终有一天会死去的人类’。无话可说的埃列什基伽勒最终决定加入立香一方，并承诺会放走捕获的灵魂。
在对战戈耳工的魔兽大队前晚安娜分别与墨莲、立香在北壁上谈心，但因为自身原因，没有收下立香给予的老奶奶的花环。
次日则是跟立香等人一同来到鲜血神殿，带领立香等人进入戈耳工的寝室，和戈耳工决一死战之后便与戈尔工一同坠入深渊，并拒绝立香的救援，立香只好把老奶奶的花环抛给她，在收下花环后含笑而去，经罗曼确认两者的灵基同时消失……
‘安娜。’安娜告诉我，她是作为戈耳工的抑止力被召唤来的。在遇到我之前，除了杀死戈耳工之外没有任何目的，独自一人游荡。然后，在和我分开后去寻在戈耳工途中，遇上了梅林，被梅林欺诈，以杀死戈耳工为条件与其结伴而行。
提亚马特，意欲前往乌鲁克毁灭美索不达米亚的创世女神，最初就被梅林封锁于梦中无法苏醒，因此金固设计了让戈耳工同步提亚马特意识与权能的策略。
当冒充成提亚马特的戈耳工被击杀时，被同步意识的提亚马特从梦中惊醒，捏死了一直在搞小动作的梦魔。
以恩奇都的相貌出现在立香等面前，其真实身份其实是提亚马特创造的孩子，真名为金固。提亚马特醒来后，拉赫穆被大量制造出来，涌出波斯湾登陆美索不达米亚。而提亚马特创造的‘新人类’拉赫姆重伤金固，走投无路的金固在一只‘特异’拉赫姆，或者说西杜丽的帮助下成功逃脱。
拉赫穆群将金固的炉心——魔术王的圣杯夺走，飞往波斯湾交给了母亲。迦勒底与各位女神在波斯湾遭遇了人型的女性——提亚马特神的头脑体【命运之女】。
她并不会直接攻击众人，只是在发出诸如「Aaaaa————」的声音，在被伊什塔尔使用宝具「山脉震撼明星之薪（An Gal Tā Kigal Shē）」被击溃后，提亚马特的灵基再构筑，真正的本体显现，前往乌鲁克。
因为在「地上」无法杀死提亚马特神，所以，众人一致决定将提亚马特神陷落到「地下」冥府。
立香和玛修两人单独来见吉尔伽美什王。
“你们该不觉得「乌鲁克的毁灭是我们造成的」吧？
「都是因为我们解放了提亚马特神」？
唉，一群蠢货，有这种惭愧，你们还早了一千年。”
‘你们没有自责的必要，本来提亚马特神也不是仅靠梅林一人之力可以完全压制的，会什么时候醒来也只是时间问题罢了。’墨莲在一旁说道，因西杜丽在离开之前，拜托了墨莲接手帮忙处理后续的工作，墨莲现在是祭祀场的代理负责人。
“听好了，只要能回收圣杯，修复人理奠基，那个特异点产生的损害就会全部化为乌有——那是谎言。
事实并非如此，死去的生命不会回来，是不可能当做没发生过的，只是会变得会合乎逻辑而已。比方说，有个被邪龙杀死的人好了，然后人理烧却被制止，特异点被消除了。
即便如此，那个人也已经死了。只是‘被邪龙杀死’的事实，会被当做‘被野兽杀死’来处理而已。这乌鲁克也一样，就算打倒了提亚马特神，解除了特异点······
乌鲁克第一王朝仍会毁灭，差别仅在究竟是被神毁灭，还是因衰退而被后人取代的这种解释发生了改变而已。
说到底，自然界中没有牺牲就不可能有繁荣，损益始终都是对得上的，失去了诸多东西，才能构筑起诸多东西。
就算魔术王那家伙不用圣杯搅乱世界，也会出现于其同等程度的负面。
这天秤上的善恶会由那个时代的道德去衡量，最终的价值将成为历史，交由后世来裁定。人类史就是像这样延续下去的存在。
你为何而战，守护什么，是个怎样的人类。这些东西无论本王还是你都无法衡量。那是你的后来者才会知晓的事。既然如此，现在就走自己认为正确的道路即可。”
“嗨！我们知道了，非常感谢，王。”
濒临死亡之际，凭着身体本能（这里指的是恩奇都躯壳的本能）前往天之丘，在那里，吉尔伽美什将乌鲁克的大杯子给予了金固，令他获得了新的魔力炉心。
最终决战开始了————
由于提亚马特的双腿明显无法支撑自己的体重，罗玛尼·阿其曼与吉尔伽美什都判断只要让她脚下的黑泥消失就可以阻断她的前进。这一计划以魁札尔·科亚特尔展开宝具「太阳历石（Piedra Del Sol）」而一时成功。
提亚马特使用技能「自我改造：EX」展开背面的构造体让自身离地起飞，却被魁扎尔发动宝具「炽焰，亦焚尽神灵（Xiuhcoatl）」击破防御结界并打回地面。
随着提亚马特利用魔力起飞而失败，继续制造出混沌之潮。而后被化身为戈耳工的安娜使用蛇发牵制住，并发动宝具「强制封印·万魔神殿（Pandemonium Cetus）」将提亚马特的一侧大角击碎。
到达乌鲁克城范围内时，提亚马特遭到吉尔伽美什的王权印章攻击，因而将吉尔伽美什狙击成致命伤，而后却被化身为天之锁的金固发动宝具「世人啊，冀以锁系神明（Enuma Elish）」束缚住，直到被在空中待命的伊什塔尔再次发动宝具击落至冥界。
提亚马特落入冥界后，被埃列什基伽勒的冥界女神权能制裁，伊什塔尔宝具级的热量不断灼烧着提亚马特。随后提亚马特将灵基回归神代（进入侏罗纪）。以黑泥为躯，化为第三阶段「自我改造：EX」的龙体，制造出混沌之潮侵蚀冥界。在混沌浪潮即将向藤丸立香一行人袭来时，从阿瓦隆徒步赶到乌鲁克的梅林及时前来救场，释放幻术将混沌之潮替换成无数的花朵。
在众人准备讨伐提亚马特，但因为BeastⅡ依然拥有不死性而束手无策之时，神秘老人再次出现。并现出其真身为冠位暗杀者（Grand Assassin）的‘山中老人’哈桑·萨巴赫。随后向其挥出舍弃「冠位」级别灵基的一刀，斩断了提亚马特的角翼并为其附加上「死之概念」。
提亚马特创造出直属使魔拉赫穆十一子拖住主角一方，并试图向上爬出冥界。在提亚马特即将逃走时，化为从者的吉尔伽美什以全盛时期的Archer职阶再次显现助阵，释放出「王之财宝（Gate of Babylon）」使提亚马特从岩壁上脱离，再次落到冥界的底端。
提亚马特发动技能世界新生「反·创世纪（Nega Genesis）」之后，被埃列什基伽勒发动的宝具「灵峰踏抱冥府之鞴（Kur Kigal Irkalla）」封印住。玛修·基列莱特展开宝具「已然遥远的理想之城（Lord Camelot）」顶住「反·创世纪」的空间，梅林与玛修连携发动宝具「永世隔绝的理想乡（Garden of Avalon）」为打败提亚马特立下基础。
提亚马特的「反·创世纪」被藤丸立香从吉尔伽美什处得到的礼装「侵刃黄金」所击破，最后被吉尔伽美什使用「王之财宝”里的最强宝具“乖离剑（EA）」释放的「天地乖离开辟之星（Enuma Elish）」击溃灵基，提亚马特在冥界里爆炸后消失。
在我接住正在下落的立香的那一瞬间，下一刻我和立香在一四周什么都没有一切都是白色的地方。
而在我们对面站着的是提亚马特神，我立刻明白了这里是精神世界，在被击杀的瞬间，藤丸立香接触到了提亚马特的灵气，而我正巧接住了藤丸立香所以被一起牵连进来了。
“你是……”
“我孕育了众多生命，也曾被众生所爱。但孩子们却把我当做跳台，并离我而去。我想一直爱着他们，想要他们永远留在我的身边。难道我的爱...都是错的吗？”
“我不知道，但孩子们都是爱着你的。所以，我必须得走了。”
‘你的爱，没有错。但是孩子终究是要长大离开父母独立的，所以，有时选择放手或许会更好。
有些父母会自愿作为自己孩子的跳台，他们把不舍藏于心，只为希望自己的孩子，能够飞的更高，走的更远。
你的那份过度溺爱和过度保护的爱，太过于沉重了，所以，你的孩子都离你而去了。’
“原来是这样吗……不要走，不要丢下我，也不要再爱我了......”提亚马特神流下泪水。
“再见了，谢谢你。”在立香和墨莲转身离去后提亚马特神消逝了。
我回过神来，四周正在崩塌，我一手抱着立香，瞬移到玛修身边，抓住她，无论如何，都要把她们带出去。
“墨莲大人，危险！”
‘向你道谢，梅林。’在巨石将要砸向我时，白色的花海从地上涌起，挡住了巨石把我们围在了里面，趁这个瞬间我带着立香和玛修一起瞬移离开冥界到地面上去了。
人与神的时代结束了，但，结束即是开始，新的时代将要来临，这是告别诸神的人类所开启的新时代。
