10.1重要的医学网站
1.PubMed检索系统
PubMed检索系统由美国国立医学图书馆(NLM)国家生物技术信息中心(NCBI)开发,用于检索Medline、PreMedline网上数据库。在互联网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,如Healthgate、Medscape、MedicalMatrix、BioMedNet等,它们一般使用MEDLINE数据库中的原始数据,通过自已的检索软件和界面为用户提供检索入口。但所有这些网站中,只有PubMed是官方网站,而且无论在信息量、使用的方便程度,还是更新速度等多方面,PubMed的优势都不可取代。正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示,PubMed是免费向公众开放的。
PubMed覆盖了全世界70多个国家5000多种主要生物医学期刊的摘要,其数据库覆盖的时间范围很长,早的可以追溯到20世纪60年代。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以借助于PubMed,我们可以及时捕获所需医学文献的最新动向,甚至可以直接获取出版商提供的免费全文。
PubMed检索系统智能化程度十分高,因为它有非常强大的词汇自动转换功能。其检索的基本原理是:在PubMed主页的检索提问框中键入检索词(即执行基本检索),系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索,系统一旦发现了相匹配的词,就停止继续搜索下面的表:
(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table):MeSH的全称为Medi-cal Subject Headings,即医学主题词,是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。其中,论述文献中心内容的主题词称主要主题词(major to picheadings),论述主题某一方面内容的词称为副主题词。主题词检索的检索结果准确性高、遗漏率低,是最佳的检索方法。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和Text Word词进行检索。例如,键入“Vitaminh”,系统将其转换成“(biotin[TIAB]NOT Medline[SB])OR biotin[MeSHTerms]ORVitaminh[Text Word]”后进行检索。
(2)刊名转换表(Journal Tanslation Table):包括刊名全称、Medline刊名缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]”后进行检索。例如,在检索提问框中键入:“neweng landjournal of medicine”,PubMed将其转换为“NEngl JMed[Journal Name]”后进行检索。
(3)短语列表(PhraseList):当检索词与MeSH表和刊名转换表未能匹配,则与短语列表中的词语进行匹配。短语表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UnifiedMedicalLanguageSystem,UMLS)和补充概念(物质)名称表(SupplementaryCon cept(Substance)Name)。
(4)着者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,PubMed即查着者索引。
如果检索词未能在以上四个表中找到匹配词,检索词则被断开,再分别查找匹配词。最终没有匹配词的话,短语中的单个词则用AND连接,在全部字段中查找。例如,对检索词“pressurepoint”,系统会自动将其转换为((pressure[MeSH Terms]ORpressure[Text Word])ANDpoint[AllFields])。如果不想将词组分开检索,可用“”将短语作为词组强制检索。
除了上述基本检索,PubMed的特征栏还提供以下检索功能:
Limits(限定)检索:对研究对象的性别和年龄、文献类型、时间范围、字段等进行限定。
Preview/Index检索:Preview:显示检中文献的条数,并提供增加检索词与前面的检索词进行and、or、not组配检索的功能。Index:按字顺对提交的检索词进行相关索引。
History:显示已有的检索策略和结果,存贮的检索策略为100个,时间为1小时。
Clipboard:集中存放选定的记录,方便打印、下载。最大存贮数为500条记录,一小时内无任何操作,记录将自动消失。
Details:可以用于查看PubMed的检索策略,即在检索框中键入的检索词被PubMed自动地转换成了哪些词,并使用了什么样的检索规则和检索语法检索。此外,使用Details键可以对检索策略进行编辑,然后再一次检索。这样我们就可以根据PubMed的检索规则,轻松调整检索策略,直至得到最理想的检索结果。
此外,侧栏上还有一些附加检索功能:
主题词检索(MeSH Database):可用来确定规范检索词,查看词义注释和树状结构表。
引文匹配器(Single Citation Matcher):通过输入已知的文献题录信息,查找特定文献。注意:刊名要准确,缩写要标准。着者姓名大小写不敏感。
期刊检索(Journals Database):通过输入刊名、缩写名和ISSN号、NLMID号进行检索。用ISSN号检索可能检索不到旧文献。
临床咨询(Clinical Queries):这是专门为临床医生设计的搜索引擎,检索方法简单,对临床医生较为实用。其中Searchby Clinical Study Category只需在检索框内输入检索词,然后选择下述类目对文献范围进行限定:therapy(治疗)、diagnosis(诊断)、etiology(病因)和prognosis(预后);同时提供Sensitivity(检出相关文献,强调查全)和Specificity(检出密切相关文献,强调查准)两种限定方法。
该页面还提供Find Systematic Reviews(查找系统性综述文献)和Medical Genetics Searches(查找医学遗传学研究文献)两个检索入口。
临床警示(Clinical Alert):从1991年开始,NIH美国卫生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目。
MYNCBI:提供个性化服务。简单注册,获得一个用户名和密码后,即可登录使用。其主要功能是存储用户的筛选条件和检索信息,对于如研究生、一般科研人员,可以用MYNCBI的筛选功能,十分方便。对于硕博导师等需要关注某课题的最新进展的,可以在用其筛选功能的基础上,使用其保存检索策略功能,并选择电子邮件通知等“推送服务”功能。
2.美国国立卫生研究院
美国国立卫生研究院(National Institutes of Health,NIH)是世界一流的生物医学中心,成立于1887年,由27个研究所和研究中心组成,同时也是美国卫生和人类服务部的8个公共卫生服务机构之一。NIH的使命是发现新知识,促进人类健康,其从事的主要工作有:指导下属实验室的研究;支持国内外大学、医学院、医院、研究所的非政府资助的科学家的研究;帮助研究人员的培训;扶持医学和卫生信息的交流。
NIH通过其网站免费向全世界提供如下几方面的信息:
(1)Health Information(卫生信息):提供按照主题词字顺排列的疾病信息,同时提供下列重要资源:①Toll free Health Hotlines:数据源自DIRLINE(Directory of Information Resources Online,美国国立医学图书馆的在线信息资源目录),包含14000多个生物医学信息源的描述及电话号码。②MEDLINEPlus:由NLM的参考咨询部开发研制,是向大众和医务人员提供医药卫生知识和信息的事实型数据库。提供的信息包括:卫生专题、药物信息、医学百科全书、医学词典,新闻、医生和医院名录等。③ClinicalTrials:收录了4000多条临床试验研究信息,内容定期更新,每条信息包括:试验主持单位、目的、内容、病人标准、是否继续招收病人、地点等;可以从Basic Search、Focused Search、Browse三种途径检索。④PubMed。⑤Combined HealthIn for mation Database(综合卫生信息数据库):创建于1985年的书目型数据库,每季度更新一次,由17个子库组成,文献类型有教材、论文、手册、报告等。可以从Simple Search和DetailedS earch两种途径检索。⑥International Bibliographic Information on Diet-ary Supplements(IBIDS)Database:饮食补充国际书目信息数据库。⑦Healthfinder:是在网上查找政府及非盈利卫生和人类服务信息的一个主要资源,其链接来自1700多个卫生相关组织的精选信息和网站。⑧Foodand Drug Administration(食品和药品管理)。
(2)Scientific Resources(科学资源):有生物伦理学、生物技术等内容,同时提供以下资源:
1)Libraryand Literature:其下的链接有:①美国国立医学图书馆提供的资源:PubMed;National Library of Medicine sLOCATORplus(美国国立医学图书馆馆藏书目、杂志、声像制品查询系统),可通过该系统查询NLM的馆藏。②NIHLibrary(WWWServer):其内有NIH的数据库和在线期刊的链接。③National Instituteof Environmental Health Sciences(NIEHS)Library:其内有Mouse Knockout&Mutation Database(MKMD)关于鼠变异的基因和表现型信息,可链接到MEDLINE和Swis sProt,提供全文。④The NIAID Rockledge LibraryOnline(NIAID,美国过敏和传染性疾病研究所)。
2)Research Training(研究培训):提供研究培训机会,也提供内科医生和心理学专家的继续教育。
3)Laboratory Resources(试验资源):①Model Organisms:提供动物模型用于生物医学研究。②Stem Cell Registry:关于干细胞的出版物题录信息和培训项目。③Lab Safety:包括工作场所安全、生物化学制品安全、辐射安全、职业卫生服务、废弃物处理等内容。
3.美国国立医学图书馆
美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)隶属于美国国立卫生研究院,是世界上最大的生物医学图书馆。收录生物医学和健康关怀方面的书籍、期刊、技术报告、手稿、缩微胶片、声像资料、数据库等。
其主页提供如下信息服务:
(1)卫生信息(Health Information):按主题排列的医学信息超级链接,也可由此进入NLM几个知名的医学数据库:①MEDLINE plus;②MEDLINEvia PubMed;③ClinicalTrials.gov;④卫生组织名录DIRLINE;⑤美国国立医学图书馆馆藏书目、杂志、声像制品查询系统LOCATORplus,可通过该系统查询NLM的馆藏;⑥可检索多个NLM检索系统的网络接口NLM Gateway;⑦数字化生命科学文献库PubMedCen tral;⑧关于毒理学、环境卫生和有毒化学物质的数据库TOXNET。
(2)图书馆服务(Library Services):提供有关目录、医学主题词表(MeSH)、NLM数据库、NLM出版物、服务、培训及基金等方面的链接。
服务项目包括:馆藏目录(Library Catalogs)、馆际互借(Interlibrary Loanand Document Delivery)、参考咨询和读者服务(Reference and Customer Services)等。