这是很残酷的打击，为了避免人们发觉他耳聋，贝多芬逐渐离群索居，自己变得愈来愈孤僻。
一八零二年贝多芬迁到离维也纳车程一小时的海利金宁静村庄作曲，他在那里完成了第二号交响曲。但耳疾恶化使他痛苦万分，因而他写下了海利根施塔特遗书，陈述悲惨遭遇与不幸。后来贝多芬又因康德的哲学观重建信心。“要忘掉自己的不幸，最好的方法就是埋头苦干”。此时他回到维也纳，乐思泉涌，一八零三年写出了雷霆万钧的《第三交响曲》。此曲原想献给拿破仑，但因拿破仑加冕称帝，贝多芬愤而涂掉拿破仑的名字，改称为《英雄交响曲》。
同年，贝多芬又写作了极出色的第九号小提琴奏鸣曲《克罗采》。一八零四年完成第二十一号钢琴奏鸣曲《华德斯坦》。隔年又接著完成第二十三号钢琴奏鸣曲《热情》与独一无二的歌剧《费黛里欧》。在这一连串作品中他表现出真正的功力，如《华德斯坦》与《热情》使世人如痴如醉。一八零六年他又作出《第四号钢琴协奏曲》和《D大调小提琴协奏曲》。
贝多芬同时发表了第五号交响曲《命运》与第六号交响曲《田园》。一八零九年完成第五钢琴协奏曲《皇帝》。这些全是永垂不朽的杰作。贝多芬的内心蕴藏着无穷的感情，细腻、超凡、和谐、十全十美。贝多芬有意将自己的意念放在曲子中。如第五号《命运》，一开始的动机就是命运之神用力敲门，第六号《田园》更可察觉出贝多芬有意对大自然的描绘第一乐章他即标明了“令人心旷神怡的乡间”字眼。
1809年拿破仑攻占维也纳，王子公孙纷纷逃难，贝多芬经济陷入困境。在战火弥漫的日子里，他依然留在维也纳，苦心创作，他的《皇帝》协奏曲就是在隆隆炮声中写出的。
由于《命运》与《田园》首次演奏并未获得维也纳人民的青睐，贝多芬有心离去前往德国，但因鲁道夫公爵、罗伯高维兹王子与金斯基公爵三人极力挽留，他才留下。日后，贝多芬写作《大公钢琴三重奏》题献给这些恩人。自法国革命后欧洲空气为之一新，民主自由与人权因而确定。贝多芬亦把音乐平民化了，将音乐从贵族中带
入全民化。贝多芬的变革与成就，功垂百世。
拿破仑兵败，维也纳又恢复欢乐的气氛。一八一二年贝多芬在伤兵救济音乐会上首演《第七号交响曲》与《第八号交响曲》，当时引起了巨大的轰动。他再次赢得维也纳人民的尊敬。贝多芬从一八零四年到一八一四年之间，肉体蒙受失聪的惨境，但在这十一年的岁月里，他的创作丰富，历史价值史无前例。他写出了人类音乐宝藏中光芒万丈的珍品。他的《第七号交响曲》没有标题，华格纳认为、
