除了尊号的问题，秦始皇还制定了其他统一的规范。如按照水、火、木、金、土五行相生相克的道理，周朝是火德，秦取代周统一天下，水克火，因此秦朝就是水德。秦始皇于是就根据卦爻，将十月初一这一天改为一年的开始，举国上下的衣服、符节和旗帜的装饰，都用褐色。由于水德属阴，《周易》中表示阴的符号叫做“元”，于是秦始皇就把数目以十进制改成以六进制，符节和御史所戴的法冠都规定为六寸，全国的车宽也统一规定为六尺，六尺为一步，一辆车驾六医马。另外，秦始皇认为仁爱、恩惠、和善、情义等儒家的思想与水德不符，所以不在全国推广这些，而是根据法律治国，主张以苛刻的手段和残酷的刑罚来统治天下。
丞相王绾说：“诸侯国如今刚刚被打败，燕国、齐国、楚国距离中央朝廷较远，如果不为他们设置王的话，恐怕这些地区的形势难以安定下来。始皇帝不如将自己的皇子封为王，让他们去镇守这些偏远地区，也便于天下的安定。”始皇帝让群臣议论这个方案的可行性，大部分人都觉得可以。
李斯却认为：“周朝刚开始得时候，文王、武王分封了很多子弟和同姓王，可是传承到后面，后代之间的关系就疏远了，各诸侯国之间像仇人一样互相攻击，诸侯国之间经常兼并、混战，以至于周天子都没办法管理。现在大秦统一了天下，已经划分了郡县，就不要再封王。对于皇子和功臣，陛下可以用公家的赋税重赏，这样无论传承多少代，都容易控制。只要天下人都没有异心，这样控制大家更容易保持天下太平；设置诸侯国却很难做到这一点。”
对于李斯的建议，秦始皇认为很有道理，他说：“天下之所以征战不休，不就是因为这些诸侯国吗？我们的将士经历这么多奋战才消灭了诸侯国，平定了战乱，天下这才安定下来。如果这时候再设置诸侯国，不等于又埋下战争的种子吗？人们再想拥有太平，恐怕就很困难了。”众大臣附议。
于是，秦始皇将天下分为三十六郡，每个郡都设置守、尉、监等官吏。为了避免不必要的麻烦，又下令收缴天下兵器，将收缴上来的兵器都熔化之后铸成大钟和铜人，然后放在皇宫里。
此外，秦始皇还统一了法令和度量衡，又规定全国车辆两轮间的宽度要保持一致，文字要用统一的篆书。而之前各诸侯国的法令、度量衡、车宽、文字全部废除。
做完这一切，秦始皇又将天下富豪人家迁到咸阳居住，在咸阳北面的山坡上仿造以前诸侯国的宫殿建造了每一个诸侯宫室，各个宫室里居住着从各诸侯国得来的美人或存放珍宝。除此之外，每个宫殿里还有精美的天桥、环行长廊、各国的钟鼓乐器。总之，宫殿之豪华、庞大、壮观，前所未有，它们象征着秦始皇统一天下的伟大功绩。
秦始皇出巡
秦王政二十七年（公元前220年），秦始皇为了想看看自己的土地是多么广袤，自己创造的功绩是多么伟大，效仿古代的舜帝，到全国各地出巡。
他第一次出巡，到了祖先的发源地，来到陇西、北地，经过鸡头山，然后在渭水南面建造信宫。后来，秦始皇把信宫改名极庙，表明它是天极的北极星。建立极庙之后，秦始皇又命人开通从极庙到郦山的道路，并修建了甘泉前殿，在两旁修建了筑墙的甬道。这个工程一直从咸阳连接到骊山。
从咸阳连接到骊山的通道，激发了秦始皇的另一个灵感。当时各地原来诸侯的势力还很强，为了加强统一，秦始皇下令在全国修建通向全国各地的驰道，这样一方面行走起来更方便，便于秦始皇管理六国旧地；另一方面，便于为前线提供战争补给；更重要的是，秦始皇以后出巡的时候，可以畅通无阻。
公元前219年，秦始皇带着王离、王贲、赵亥、王绾、李斯等大臣到东方巡视，来到山东邹县的峄山。秦始皇为自己的功德感动，在山上立下石碑，又让儒生们在上面记录自己泰山祭天、梁父山祭地和遥祭名山大川的事迹。接着，秦始皇就率领群臣登上泰山，筑坛立碑，举行了成大的祭天盛典。
石碑上面这样写着：始皇帝登基之后，政治清明，臣子谨慎，终于在第二十六年（公元前222年）统一天下，获得了四海的归顺。于是始皇帝亲自巡视远方，登上泰山，遥望东方。思及先人的伟绩，想起先祖最初的事业，为大秦现在的功德而感到自豪。始皇帝在全国实施治世之道，发展各种产业，振兴一切大德，弘扬一切美善，并将这些传承给子孙后代，永远都不再改变。始皇帝为政清明，终于平定了天下，但他对国政丝毫不懈怠，依旧每天起早贪黑，为国家的长远利益而谋划；同时专心教化民众，以倡导教育人民，使圣人的旨意都得到尊奉。从此，天下贵贱清楚分明，男女有别，大家都虔诚地遵守自己的本分。大秦的光明照耀海内外，天下处处太平，后世永远遵守始皇帝的德政，让子孙后代得到教化。后人一定要遵从始皇帝的遗诏，永远供奉始皇帝的重大告诫。
然后，始皇帝又率领群臣在梁父山举行祭地，接着沿着渤海岸往东走，以此经过黄县、腄县，征服成山，登上之罘山，又树立石碑歌颂秦的功德。继续向南走，秦始皇登上了琅邪山，他很喜欢那里，于是在那里停了三个月，命人重新修筑了琅邪台，依旧立石碑，上面刻写上自己的功德。
这个碑文的大意是要说明：始皇帝一登基就严明了法度，整饬了朝纲，表明了人事之宜，提倡子孝父慈。始皇帝是一个圣人，他为大家讲述各种道理，亲自登上东方的土地来犒劳士兵。他施行重农抑商的政策，让天下的百姓都富裕起来。天下人都为始皇帝的政策欢喜，人人都恭顺地听从他的命令。始皇帝还在全国统一了度量衡，整顿了不好的习俗。如今，他千里迢迢地来到东方，就是为了怜悯爱惜百姓，为此日夜不肯休息，目的就是为大家谋造福利。他勉励百姓劳动时不要误了农时，天下在他主导下，一切繁荣昌盛，百姓们不必再忍受战争之苦，谁也不想再用兵动武。这样的天下，六亲终得相保，盗寇不复踪影。大家都欢欢喜喜地遵守法度，都牢记法规。四海之内，都是始皇帝的国土，东到大海，西越过沙漠，南到北户，北越过大夏。凡是有人的地方，没有一个人不臣服于始皇帝。他的功劳超过了五帝，他的恩泽遍及到马牛，没有一个人不受到他的功德，举国上下，其乐融融。
秦始皇登上琅邪山之后，为那些愿意迁到琅邪台下居住的百姓免除十二年的赋税徭役。人们听到这个好消息，三万多户都赶来住在这里。然后秦始皇继续到海边巡行。从前齐地的人告诉始皇帝说：大海中有三座神山，即蓬莱、方丈、瀛洲，有仙人居住在那里，希望始皇帝准许自己斋戒沐浴，带领童男童女前去求仙人。始皇帝大喜，于是就派徐福挑选几千童男童女到海中去寻找仙人。
在返回京都的时候，始皇帝途经彭城，他特意斋戒祈祷一番，希望得到那只落水的周鼎。但是一千人捞了很久，也没打捞出鼎，只好作罢。一行人又转到西南地区，渡过淮河之后，来到衡山、南郡、湘山祠。在湘山祠遇到了大风，船无法前行。始皇帝听本地人说这里有湘君，就打听湘君的来历。大臣告知之后，并说尧帝的女儿，也就是舜帝的妻子埋葬在附近。始皇帝就很生气，派人将湘山上的树全部砍光，曾经茂密的湘山就只剩下裸露的赭红色土地，看起来好像流血一样。秦始皇不管这些，大家继续巡游，最后从南郡经由武关回到京都咸阳。
公元前218年，秦始皇又到东方巡游。出游的大军走到阳武县博浪沙，楚国公子张良和一名力士前来行刺，虽然这两名刺客没有击中秦始皇的车辆，但始皇帝还是吓了一跳。于是在全国重金搜捕刺客，但没有捉到。然后秦始皇登上之罘山，立石碑著文，然后又到东观刻石立碑，再次到琅邪，后来经上党返回咸阳。
从此，秦始皇一有机会，就到全国出游：公元前219年和公元前218年的两次东巡，公元前215年北巡，公元前210年南巡。最后，秦始皇死在出巡的路上。秦始皇每次出巡的规模都很大，所访问的地方也很多，以至于东起大海，西到长城的起点，南起衡山，北到包头，都有秦始皇的足迹，他真正让自己的足迹遍布帝国的各处。
入海求仙药
秦始皇统一天下之后，对东方国土比较关注，曾经两次东游。东游的目的，一方面是为了安抚、开拓东方国土，另一方面就是为了寻找长生不老之术。
秦始皇第一次东游的时候，曾经泰山立石歌颂自己的功德，后来一路向东、南下，循着海边出游，偶尔看到海洲湾内出现海市蜃楼，认为东方有仙人。这时候的始皇帝已经建立起盖世功勋，就渴望自己能长生不老，永远守着自己的功德。
可是怎样才能长生不老呢？正当秦始皇发愁的时候，狩猎用的大苑中发生了一件奇怪的事情。
大苑中原本囚禁着许多罪犯，这些犯人常常因为无法忍受酷刑，最终被折磨死，大苑中都是他们的尸体，无人埋葬。但这些死人的尸体会招引一种很像乌鸦的鸟儿，它们衔着一种草，将草放在死者的脸上。一会儿，死去的人就会渐渐醒过来，不久就能站起来活动了。
大苑的主管看到这么奇怪的事，立刻将这种鸟和草都呈送给秦始皇看，秦始皇也不知道这是什么鸟、什么草，于是就拿着这些东西派人请教当时的著名学者鬼谷子。鬼谷子看了看，说：“这种草叫不死草，又叫养神芝，出自东海祖洲的琼田中。一棵这样的草能救活一个人，救了人之后，这种草的鲜气就会散失，不能再用了。”
秦始皇听说这种草的作用之后，心想：既然这种草有起死回生的作用，一定可以让人长生不老，我一定要找到它。有人还告诉秦始皇说，东海的扶桑岛上有一种扶桑树，这种树九千年结一次果，吃了它的果实一样可以长生不老。这就更坚定了秦始皇去东海的信心。
徐福是鬼谷子的徒弟，他知道秦始皇的心思之后，立刻向秦始皇上书，为他描绘东海“三神山”（即蓬莱、方丈、瀛洲）的胜景，并表示自己愿意前往东海为始皇帝寻找不死药。秦始皇原本就对东海充满憧憬，听到这里之后，立即批准徐福的请求，让他带领着数以千计的童男童女到东海寻找长生不老之术。
徐福是原来的齐国人，他博学多才，通晓天文地理，而且同情处于秦始皇暴政之下的百姓，因而在齐地享有很高的威望。当人们听说他被秦始皇派去寻找长生不老药时，一点都不怀疑这是个骗局。
徐福带领童男童女走了之后，好几年都没有音讯。秦始皇苦苦等了他九年，没有结果，于是再次东游，没想到却遇到了徐福。徐福担心秦始皇怪罪，骗他说，海中有很厉害的大鲛鱼，船很难接近，必须派善于射杀的人先去杀死鲛鱼，他才能登陆“三神山”获得不死草。奇怪的是，当夜秦始皇就做了一个梦，梦中的情形与徐福所讲的差不多；他还梦到了一个像人一样的海神。第二天，秦始皇立刻寻找占卜师为自己解梦，解梦的结果是：神仙的确很难相见。秦始皇这下更相信了徐福，于是答应他的请求，派善射的人跟他一起东渡。
这次，跟随徐福东渡的，除了三千童男童女和善射者，还有百工巧匠、武士，徐福还携带了五谷种子、粮食、器皿、淡水等物，一行人浩浩荡荡地向东出发了。不过这次徐福仍然没有找到不死药，反而在熊野浦登陆后发现了“平原广泽”（今日本九洲）。徐福唯恐触怒秦始皇，便带着童男童女和五谷种子留在了那里，没有再回转。从此，东方的“平原广泽”上，人们在那里种植农作物，学习捕鱼和锻冶，那里独立成了一个小国家。
而秦始皇也没有将希望全部寄托在徐福身上，他后来还派了燕人卢生去求过羡门、商誓之类仙人，也派过韩众、候公和石生等人寻求不死灵丹，但都没有结果，秦始皇一天一天地老去。
焚书坑儒
秦王政三十四年（公元前213年），秦始皇召集群臣讨论统一思想的问题。
当时的情况是，六国虽然灭除了，但社会上流行百家争鸣，社会思想仍然像当年诸侯混战的局面一样不统一，秦始皇认为这不利于国家的安定，于是让大家解决这个问题。
仆射周青臣说：“原来秦国的土地不过方圆千里，现在天下尽归陛下所有，日月照到的地方都是我们大秦的国土。陛下不但消灭了诸侯，还创造性地将诸侯改造成郡县，天下的百姓从此避免了诸侯混战，不再担心受到战乱的困扰。这些都是陛下的功劳啊。陛下的功劳一定会千秋万代地传承下去，古往今来没有人再能与您相比。”秦始皇听了这番话，非常高兴。
淳于越对秦始皇说：“从前殷商和周朝统治天下的时候，他们都将国土分封给王室子弟和有功之臣，让他们帮助天子治理天下。这两个朝代都传承了一千多年。现在陛下拥有天下所有的土地，你的儿子和兄弟却都只是普通百姓，这样国家可能就会出现齐国的田常、晋国的六卿犯上作乱的事，陛下还能靠谁来治理天下呢？我从来没有听说过不遵循古制就能长久存在的道理。刚才周青臣当面奉承陛下，却不敢指出您的过失，这样看来他也不是什么好的臣子。”
他们两个的观点完全不同，秦始皇也不知道谁对谁错，就让大家继续议论。
丞相李斯说：“五帝时代的制度，也不是简单地重复上一代，夏、商、周的制度也不是完全继承前一朝代，而是根据实际情况制定适合自己的制度。他们当时所制定的制度都符合当时的情况，由于时代变了，制度也应该跟着变，而不应该因循守旧。现在陛下统一了天下，建立其不朽的基业，这不是儒生们所能理解的，淳于越所说的是夏、商、周三代的事，哪里值得效仿呢？”
李斯又说：“周朝的时候，诸侯纷争，大家广招天下游说之士，每个人的观点都不一样，每个国家所依据的思想也不一样。现在天下统一了，一切都应以陛下为主。百姓就应该致力于农工生产，读书人就应该致力于学习法度。但是现在的儒生不学习法度，却终日无事效仿古代的旧习，并以此诽谤现在的社会，纯属惑乱民心。古代诸侯众多思想不统一，但现在天下政令应该统一，思想也应该统一，一切都应以始皇帝的思想为思想，不应该与朝廷对着干，私下里议论始皇帝的法令。这就要求百姓们不要公然议论法令，当官的人不要在心里议论法令，任何人更不能为了哗众取宠而追求奇异思想，当然也不能带头制造谣言，否则皇帝的威严就会下降，拥有一致思想的人便会结党营私。所以臣以为，一定要禁止不同的思想。我请求陛下毁掉不是秦国的典籍，将天下人收藏的《诗》、《书》、诸子百家等其他思想的著作都烧毁。如果有人议论《诗》、《书》，就处以死刑，如果谁借古非今，就满门抄斩。官员如果知道谁私藏了这些书而不举报，要跟藏书者获得同样的惩罚。如果命令下达了三十天仍然有不遵循命令者，就在他的脸上刺字，然后发配到边疆去修长城。如果谁想了解法令，陛下可以设置专门的官吏教化大家。”
