表面看来，《唐书》版的“杨文干兵变”逻辑关系严密，叙述得当，分析也是入情入理，好像是真的。然而，小玉在深入研读和分析了大量的史料之后，认为此事疑点甚多：
首先，如果李建成果然是谋反了，那他为什么非要跑到李渊那里去谢罪呢？眼见着事情已经败露，与其甘为鱼肉，为什么不放手一搏，索性搞他个政变呢？人活一口气，难得拼一回，说不定还真能拼出个柳暗花明新天地呢？他怎么就那么有把握老李不会大义灭亲呢？
其二，李建成让杨文干为自己招募骁勇充当东宫卫士和送盔甲给杨文干这两件事情都不足以成为他谋反的证据。
你们想啊，李建成他可是太子耶，他有权力选拨一些素质优良的人（不足两千）来充当侍卫。况且，当时的法律不仅不禁止他这样做，反而以明文的形式肯定了他的这种权力。话也说回来了，任何一个王爷，包括秦王李世民在内，都可以这么做。就拿李世民来说吧，他的秦王府中不也有八百卫士嘛！
另外，李建成送盔甲给杨文干，很有可能仅仅是为了把那些骁勇武装起来。更何况，他送的数量又不多，如果是一万副，那事情的性质肯定就变了。再说了，李建成为什么不直接写一封密函，白纸黑字，意思表达更为准确，犯得着让大老粗杨文干抓耳挠腮地费力猜测吗？
其三，如果真如《唐书》所言，李建成主动承认了犯上作乱的事情。那么，李渊为什么还要召杨文干来觐见呢？你已经知道杨文干要谋反了，用一纸文书就想把他召来，除非杨文干是大傻蛋、二百五、“十三点”。这样做，岂不是脱了裤子放屁——多此一举嘛？唯一合理的解释就是：李渊觉得此事大有蹊跷，所有就想召杨文干当面对质，澄清疑点。
其四，杨文干是于阳历7月21日发动叛乱的。然而，仅仅过了四天，也就是到了25日，他就兵败身死了。如果真是蓄谋已久的叛乱，怎么会出现士兵纷纷溃散的情形？又怎么会仅仅维持了四天就彻底失败了呢？是杨文干太菜，还是李世民太厉害？（依小玉之见，）都不是。最合理的解释应该是这样：杨文干临时决定反叛，仓促之间，他既没有做好士兵们的思想动员工作，也没有在军事上做好有力的准备，所以很快就被“拍展”了。
最后，如果说李建成蓄意发动政变的说法成立，那么由此就可以反证出李世民是完全没有过错的。而且，他不仅没有过错，反而还在平叛的过程中立下了大功。如果真是这样，那么，李渊对李世民和他的党徒理应加以封赏。可是，我们看到，在事件最后的处理当中，秦王党的杜淹（杜如晦的叔叔）和太子党的王珪都遭到了流放。可见，李渊对于两党是各打了五十大板。这难道不蹊跷嘛？
透过以上这五处疑点，小玉经过缜密的思忖和审慎地推理，得出了一个惊世骇俗的结论：“杨文干事件”实际上是李世民为了扳倒太子而精心策划的一个大阴谋。
整个事情的经过应该是这样……
