自从国内打算设立创业板市场以来，业内呼声一直很高，人们对创业板这个新兴事物充满了热情与希望。与此同时，不得不考虑创业板出台之后在运行中会产生何种问题。作为理论研究，需要对此进行深入的分析，以便防患于未然，使创业板市场自设立之初就能获得健康稳定的发展，并对国内的经济起到应有的促进作用。
一、流动性问题
鉴于创业板市场是一个高风险的市场，容易产生过度投机的现象，加上国内现行的交易制度是单向交易，即只能先买后卖，而不能先卖后买，因此，国内创业板市场在流动性方面有可能出现两个极端：当创业板市场出现热炒时，股价不断上升，成交量急剧放大，呈现出高流动性；当创业板市场炒到一定高位时，主力机构出货，股价一路下滑，成交量迅速缩小，市场在长时间的低迷状况下，只能维持很低的成交量。出现这两种极端的原因在于，在单向交易的条件下，机构只有将股价炒高了才能赚钱，只有搞热了股市，成交量不断放大，机构才有可能在高位顺利出货。而机构一旦出货，就会迅速离场，待股价跌深后才会重新进场吸货。在这种情况下，创业板将会在较长的时间里处于低流动性的状态，这对市场的发展将是十分不利的。美国证券交易所曾经开辟过一个小盘股市场（ECM，Emerging Company Market-place），由于采用类似主板市场买卖竞价交易，因此流动性过低，最后导致关闭。而美国NASDAQ 市场之所以能够保持较高的流动性，关键在于这一市场的做市商制度，做市商有责任在股价暴涨暴跌或交投不活跃时参与做市有利于保持市场的稳定性和流动性。
香港的创业板市场也曾经出现缺少流动性的问题，其中一个重要的原因就在于香港的创业板市场没有实行做市商制度。国内在开放创业板市场时，应考虑是否采取与主板市场买卖双方竞价交易完全不同的做市商制度。
二、高风险问题
目前，许多人都积极准备在创业板市场投资，但大多数人只看到了创业板市场的机会，而忽略了创业板市场的风险。实际上，创业板市场本身就是一个高风险的市场。进入创业板市场的公司只是一些有一定前景的公司，公司本身规模不大，有些公司业绩较差，公司发展的不确定因素很多，投资失败率很高，甚至个别公司刚刚发行上市时间不长，就有可能破产摘牌，这将导致极大的投资风险，再加上投机炒作的因素，创业板市场风险是很高的。
纵观世界各国，在创业板市场触礁沉船的事件比比皆是。例如，国际金融大投资家索罗斯，起初对美国股市高科技网络概念股并不看好，但是这些股票持续暴涨，索罗斯领导下的量子基金终于忍受不住诱惑，于1999 年第四季度全军杀入这些股票。今年初，量子基金确实赚了钱，但好景不长，今年3 月中旬开始，美国高科技及网络股大幅暴跌，NASDAQ 市场指数在短期内跌幅达到50%以上，量子基金在一个月内就损失了30%～40%左右，只好宣布关闭。又如，香港的创业板市场虽然开放时间不长，但也产生了极大的风险，许多公司上市一个月内市值就下跌30%以上，有的公司甚至暴跌60%以上，给二级市场上的投资者带来了严重的损失。因此，必须加强有关创业板市场的风险教育，提高风险意识。同时，对创业板市场的投资者应适当选择，一些没有承担风险能力的个人投资者应当限制进入。最后，应该采取严格的保荐人制度，这不仅有利于增强市场信心，而且可以有效地减少公司给市场造成的巨大风险。
三、过度投机问题
创业板市场比主板市场门槛要低，在创业板上市的公司规模小、题材大，容易被炒作，加上涨跌停板的限制可能会放松，这就为庄家炒作提供了广阔的空间。特别是进入创业板市场的主要是机构投资者，炒作小盘股，船大调头难，一旦重仓持有一只股票，必然要炒到很高的价位，否则难以出货。
值得注意的是，进入创业板市场的机构投资者以公有机构为主，受产权制度的影响，很可能出现类似于国内国债期货市场的问题，即公有机构动用公家的资金炒作，不怕亏本，敢于大胆炒作。这种现象如果在创业板上出现，不仅会引起创业板市场的过度投机，也会导致严重的交易混乱。对此问题，必须具有清醒的认识，并作好必要的预防工作。
在创业板市场开放之初，在缺乏管理经验、监管手段不完善的条件下，如果过度依赖市场化，将会产生严重问题，因此在创业板市场开放之后，必须注意加强市场监管。首先，在开放创业板市场时不仅应考虑设立涨跌停板制度，而且最好设立曾经在A股市场上采用过的报价时的“通道限制”（即报买卖单时不能超过的价位范围）。“通道限制”措施，可以起到涨跌停板的作用，有利的抑制庄家操纵价格的行为，而且可以保证证券交易的连续性。其次，建立对超量报单和价格异常波动的询查制度，当事人有责任向监管者说明情况，监管者有权利向当事人查询原因。第三，建立有效的实时监管制度，发现问题及时检查，及时处理并公告。
四、场内并购问题
目前大批中小企业积极争取在创业板市场上市融资，为企业扩大发展创造条件。但是许多中小企业家也许并没有意识到，在创业板市场上市的公司盘子小，属于全流通概念，这就为场内并购提供了充分的条件。有些中小企业家千辛万苦地创业，又千方百计地争取上市，但一旦上市后，就有可能被市场主力机构通过场内并购的方式吃掉。因此，在创业板市场上，兼并与反兼并就成为需要深入研究的课题。从总的方面讲，市场中的兼并活动有利于产业结构的调整，有利于给企业增加合理的外部压力，促使企业不断提高经营管理水平。但在创业板市场上市的企业一般比较弱小，难以抵制不正常的恶意并购。因此，一方面需要制定创业板市场有关合理并购的法规，另一方面，作为创业板市场的上市公司，也必须掌握必要的反并购知识，在公司组织机构安排、公司董事会及股权设计上，事先制定出防范措施，做到有备无患。
五、退出机制问题
国内主板市场未能很好地解决上市公司的退出机制问题。许多亏损累累的企业，一旦在二级市场上市，就很难退出。上市公司退出市场的主要障碍来自于三个方面：首先是地方保护主义使本地严重亏损的上市公司难以从股市退出；其次，严格的审批制使上市公司成为宝贵的“壳”资源，在千军万马争过“独木桥”、千千万万的企业排队争取得到批准上市集资的条件下，企业上市成为一种垄断，只要企业能上市，不论业绩如何，都会身价倍增，于是以买“壳”卖“壳”为内容的资产重组应运而生，这就是导致主板市场暴炒“ST”、“PT”股票，使绩差公司难以退出的根本原因。最后，如果上市公司真的退出了二级市场，而广大投资者是对经过政府严格审批的公司投资，因上市公司退出而带来的巨额投资损失谁来负责，如何向广大投资者交代，这也是使绩差公司很难退出的一个重要原因。
在创业板市场中，上市公司的不稳定性和风险性，均要求创业板市场的上市公司能够以“信息披露为本”，由投资者自由选择为主，绩效太差的上市公司就应当通过退出机制被市场淘汰，使创业板市场真正起到扶优罚劣的作用。但是，要在创业板市场中建立合理的上市公司退出机制，就必须减少不必要的行政干预，在上市公司的发行上市制度选择上实行注册制。从审批制到核准制再到注册制，这不是一个简单的过渡，而是涉及证券市场一系列制度的配套改革。我们不能不看到，目前准备到国内创业板市场上市的企业还只能到有关的审核部门去排队等待批准。在这种发行上市的制度下，如何在创业板市场建立合理的退出机制，是一个值得深入研究的问题。
