在1999年举行的国际病毒分类委员会第七次报告中，将所有已知的病毒根据核酸类型分为DNA病毒——单股DNA病毒，DNA病毒——双股DNA病毒，DNA与RNA反转录病毒，RNA病毒——双股RNA病毒，RNA病毒——单链、单股RNA病毒，裸露RNA病毒及类病毒等八大类群。另外，还增设亚病毒因子一类。
在这个报告中大约有4000种病毒被人类认可，设有三个病毒目，64个病毒科，9个病毒亚科，233个病毒属，其中29个病毒属为独立病毒属。亚病毒因子类群，不设科和属。包括卫星病毒和传染性蛋白质颗粒或朊病毒。还有一些属性不是很明确的属就叫作暂定病毒属。
在自然界中病毒分布非常广泛，对细菌、真菌、植物、动物和人都可以感染，它们通常都会对自己的宿主产生危害。不过在有些情况下，病毒同宿主一起共存而不引起明显的疾病。
