一个新创企业进入了企业孵化器，就变成了企业孵化器的在孵企业。在孵企业是相对于企业孵化器而言的，是正在企业孵化器接受孵化、培育的新创企业。企业孵化器与新创企业、在孵企业之间有着密切的关系。
1.新创企业需要专业技术企业孵化器的帮助
创业是在几乎没有任何资源的条件下，创业者以其掌握的创意为杠杆吸引和组合外部的企业能力和资源的过程，或者创造新颖的产品或服务并实现其潜在价值的过程。创业过程面临着许多困难和问题，也存在着许多风险，特别是在技术、管理、资金等方面。新创企业在发展的初期可以说困难重重，风险很大，科技型新创企业更是如此。科技型新创企业一般是基于创新技术的市场化而发展起来的，其初创者一般是某一方面的专业技术人员，缺乏资金，缺乏管理和市场经验。初创者可能有了一些新的构思，或者有了一些新的设想与思路，但是还很不成熟，很不完善，即使技术本身是可行的，但要真正做成一种产品，形成一种产业，还需要经历一系列复杂的产业化、市场化过程。如果某一环节稍有欠缺，常常会前功尽弃。据统计，美国新建小企业能够存活5年的只有20%，能够存活10年的只有10%。这么高的失败率严重影响创业者的创业热情。我们认为，新创企业失败的主要原因是缺乏专业化的服务、良好的创业氛围和发展平台。从根本上说，新创企业还没有一个良好的成长环境。实际上，新创企业就像一棵幼苗或者一名婴儿，自身生存和发展的能力缺乏或不足，适应外部环境的能力比大企业或成熟企业差得多，需要更加特殊的呵护，需要一个特殊的更加优越的成长环境，需要得到外界更多的帮助。
专业技术企业孵化器就是为了满足某一专业技术领域（例如软件技术、集成电路技术、生物医药技术等）新创企业发展需要而出现的一种新的组织形式，是通过各种渠道帮助新创企业组织和协调各种新创企业所需的资源，培育新创企业能力的理想组织。专业技术企业孵化器为进入企业孵化器的在孵企业营造一个适宜生长并且能够发展壮大的良好环境，除提供一般综合性企业孵化器的基础服务外，主要为新创企业提供专业技术咨询、专业技术测试、专业化的辅导和专业化的管理培训等核心与增值服务，使在孵企业可以集中精力发展自己的主要业务，提高自己的核心能力。专业技术企业孵化器可以利用自己的专业优势培育和孵化在孵企业，帮助在孵企业把握发展方向，减少决策失误，提高生存、竞争与发展能力。同时，与一般综合性企业孵化器一样，专业技术企业孵化器利用规模经济效应和分工专业化优势，降低在孵企业的管理成本和交易成本；利用低廉的房租和政府的优惠政策，可以减少在孵企业的生产成本。这样，专业技术企业孵化器就可以降低在孵企业的创业成本，减少创业风险，提高在孵企业的成活率和成功率，提高在孵企业的发展能力。
2.专业技术企业孵化器与新创企业的关系
新创企业是专业技术企业孵化器的孵化对象，专业技术企业孵化器与新创企业之间是孵化与被孵化的关系，而非领导与被领导的关系。专业技术企业孵化器为新创企业（在孵企业）提供的是一种外部服务，帮助新创企业（在孵企业）培育创业团队，建立现代企业制度，帮助新创企业（在孵企业）配置技术、人才、资本、信息、市场等各种资源，提高在孵企业的核心能力。
专业技术企业孵化器与在孵企业之间是一种互动关系。专业技术企业孵化器的经营是一种“过程的经营”，专业技术企业孵化器的成功与否与在孵企业的成长紧密相连。专业技术企业孵化器与在孵企业在互动运行中以经济核算为标准，是一种完全独立的经济核算与经济利益关系。这种关系可以保证专业技术企业孵化器与在孵企业完全按照市场化原则互相选择、优化组合。
专业技术企业孵化器一般不能参与或干涉新创企业（在孵企业）的内部管理，即使对于参股孵化的企业，也只能按照公司治理结构，通过股东大会或董事会参与在孵企业的决策。
3.专业技术企业孵化器对新创企业的选择：选择哪些新创企业作为自己的在孵企业
专业技术企业孵化器与在孵企业可以说是一个利益共同体。专业技术企业孵化器为在孵企业提供各种服务，特别是专业技术服务，将在孵企业孵化、培育成功，并发展壮大，然后从在孵企业的成长中获得自己的利益。在孵企业能否孵化、培育成功并且发展壮大，直接关系到专业技术企业孵化器的利益。在孵企业能否成功，在很大程度上取决于在孵企业本身，或者对专业技术企业孵化器来说，取决于对在孵企业的选择。在孵企业的选择直接关系到在孵企业的成活率和成功率，关系到在孵企业能否发展壮大。选择一个好“种子”是成功的一半，只有经过精心选择的“种子”才可能孵化、培育成功，成为茁壮成长的企业。因此，专业技术企业孵化器需要对新创企业进行全面的了解，特别是了解新创企业的商业计划、创业者的素质、创业团队、拥有的创意、产品或技术，对新创企业进行严格审查和慎重选择，并实行工作程序化、标准化，选择出有发展前途的新创企业进行培育和孵化。
关于在孵企业的选择，有一些研究与应用成果（颜振军，2000；默罕·哈扎利·默罕·云纳斯，2002）。我们认为，专业技术企业孵化器选择在孵企业可以按照下列程序进行：
第一，专业技术企业孵化器和有入住意向的新创企业之间的信息交流和沟通，包括专业技术企业孵化器的宣传，有入住意向的新创企业对专业技术企业孵化器的了解、分析和选择，入住的意向、入住的决策等。
第二，新创企业准备并向专业技术企业孵化器递交入住申请和商业计划书。商业计划书是创业者或新创企业为了实现未来增长战略所制定的详细计划，主要用于向投资方、风险投资商等说明公司未来的发展战略与实施计划，从而取得投资方或风险投资商等支持的一份商业计划报告。同时也是展示自己有实现战略和为投资者带来回报能力及拥有资源实力的商业计划报告。这里的商业计划书是新创企业向专业技术企业孵化器提交的全面介绍公司运作情况及阐述未来发展前景、增长潜力、融资要求、服务需求等方面内容的书面材料。商业计划书包括下列内容：管理团队简述；新创企业的智力背景，包括市场分析、研究论文、专利成果等；商业评估机构对企业在投资者投资前、后的价值估算；出售最少股权换取最多投入的交易结构等。
第三，对新创企业及其商业计划书的审核与评估。评估包括技术评估、经济评估、市场评估、法人评估等。通过审核与评估，主要了解新创企业的创业团队、管理团队的素质、水平和能力；了解技术水平、产品的市场前景、竞争能力、对潜在市场的把握能力等。这一部分工作主要由专家咨询委员会的专家进行。
第四，根据审核与评估的结果，结合其他情况，选择确定在孵企业。
第五，在孵企业与专业技术企业孵化器签订入住、培育和孵化协议。
需要说明的是，这里的“入住”并不是说在孵企业一定要进入专业技术企业孵化器，而是指在孵企业接受专业技术企业孵化器的服务。在孵企业可能在专业技术企业孵化器的内部，利用专业技术企业孵化器提供的办公场所接受专业技术企业孵化器的服务；也可能在专业技术企业孵化器的外部，但是同样接受专业技术企业孵化器提供的服务。专业技术企业孵化器既可以采用实体形式，也可以采用虚拟形式。在孵企业既可以在专业技术企业孵化器的内部接受服务，也可以在专业技术企业孵化器的外部接受服务。
在孵企业的选择除了需要按照一定的程序进行外，还需要制定相应的选择标准。制定明确的在孵企业进入和毕业的标准是国外企业孵化器的成功经验之一（李志能，2001）。目前，不同的企业孵化器之间并没有统一的标准。专业技术企业孵化器应该结合自身情况，制定自己的在孵企业选择标准。不同专业技术企业孵化器的情况不同，侧重点也不同，应当以发展的、前瞻性的眼光来选择在孵企业。在制定选择标准时，主要需要考虑以下因素：
第一，新创企业的产业和行业特性。在孵企业必须从高新技术企业中选择，必须从从事高新技术产品的研制、开发、生产和销售的新创企业中选择。因为我国政府发展专业技术企业孵化器的目的就是促进科技成果转化，促进高新技术产业发展，培育科技型企业和企业家，促进经济发展。专业技术企业孵化器需要体现政府的意愿，注重专业技术企业孵化器的公益特性。这样，有利于取得政府的政策和资金支持，有利于专业技术企业孵化器自身的健康发展。而一般的生产企业、贸易企业、中介组织等不能进入专业技术企业孵化器成为在孵企业。
第二，管理团队。在孵企业必须具有一定的管理基础，形成一定的管理团队，特别是主要负责人的管理思路、发展思路必须清晰、可行，能够与专业技术企业孵化器进行充分合作，与其他服务单位充分合作。当然，作为新创企业，管理基础、管理水平不能要求太高，也不可能太高。否则，也不会有入住专业技术企业孵化器的意向。
第三，创业者。创业者在新创企业中具有非常重要的作用，甚至在一定程度上决定着新创企业的发展状况、发展潜力和发展前途。专业技术企业孵化器需要充分考虑创业者的教育程度、素质、能力、潜力、信用状况、创业热情、创新精神、合作精神等。
第四，新创企业的产品、技术和发展前景。在孵企业必须是预计产品市场竞争力强、潜在市场占有率高、技术先进的具有迅速成长潜力、发展前景良好的新创企业。在孵企业的发展及发展前景直接影响专业技术企业孵化器的发展及发展前景。只有在孵企业获得成功，专业技术企业孵化器才能获得收益，得到发展。需要注意的是，分析新创企业的产品、技术和市场前景时，不能停留在当前的行业与市场状况，而是应该着眼于未来社会经济以及科技的发展。
第五，新创企业支付服务费用的能力和方式。专业技术企业孵化器实行企业化运行，对在孵企业收取服务费用。因此，必须选择具备支付服务费用能力的新创企业。在孵企业可以采用现金支付方式，也可以采用出让一部分股权的支付方式。如果一个新创企业没有现金支付能力，也不愿出让一部分股权，则不能成为在孵企业，专业技术企业孵化器不能为之提供相应的培育和孵化服务。
第六，新创企业主要负责人接受建议并遵照执行的意愿。一个新创企业要想成为在孵企业，其主要负责人必须具有接受建议并遵照执行的意愿，愿意接受专业技术企业孵化器的培育和孵化，愿意接受专业技术企业孵化器提供的服务和帮助。如果新创企业的主要负责人刚愎自用，不愿意接受专业技术企业孵化器的建议，不愿意接受专业技术企业孵化器的培育和孵化，不愿意接受专业技术企业孵化器的服务和帮助，则这种新创企业完全没有必要申请入住专业技术企业孵化器，即使入住，也不会有什么好的效果。因为双方缺乏合作的基础。
