当细菌划线接种到固定平板培养基上后，在适宜的培养条件下。细菌便迅速生长繁殖。由于细菌细胞受固体培养基表面或深层的限制，故不能在液体培养基中那样自由打散，因此繁殖的菌体集落，通常称之为菌落(Colong)。由于平板划线的分散作用，单个菌落来源于细菌的一个细胞，生长一定时间后便肉眼可见，挑选一个菌落移种另一固体斜面培养基上，即可获得细菌的纯培养。
各种细菌在一定条件下形成的菌落的大小，形状，光泽，颜色，硬度，透明程度等。所以细菌菌落特征是细菌的细胞结构与生长行为，如细菌的夹馍，它的存在与否和菌落形态等有直接关系，肺炎链球菌因具有夹馍就形成光滑型菌落，其表面光滑黏稠，不具夹馍的菌株形成的菌落为粗糙型，菌落表面干燥，有皱折，表明菌落特征和细菌细胞的结构密切相关。
菌落的形状和大小不仅决定于菌落中细胞的特征，而且也受到周围菌落的影响，菌落靠得太近，由于营养物质有限，有害代谢物的分泌和积累，因而生长受到抑制。所以在平板分离菌种时，常可看到平板上互相靠近的菌落都较小，而那些分散开的菌落均较大。即使在同一菌落中，由于各个菌落中，细胞细胞所处的空间位置不同，在营养的摄取及空气供应等方面亦都不一样，所以在生理上，形态上或多或少会有所差异。
在平板培养基上形成的菌落往往有三种情况，即表面菌落，深层菌落和底层菌落，上面所介绍的菌落特征都是指表面菌落。某些菌落在胶培养基中生长繁殖时，能产生明胶酶水解明胶。如果将这些菌种穿刺接种在盛有明胶养基的试管中，则由于明胶被水解形成不同形状的溶解区，由于特定的细菌形成一定形状的溶解区，所以是细菌分类的项目之一。
繁殖
细菌是非常微小又原始的生物，所以它们的繁殖方式及在培养基上的生长情况与高等动植物细胞有较大的差异。
古细菌
古细菌(archaeobacteria)(又可叫做古细菌或者古菌)是一类特殊的细菌，多生活在极端的生态环境中，具有原核生物的某些特征，如无核膜及内膜系统；也有真核生物的特征，如以甲硫酸起始蛋白质的合成，核糖体对氯霉素不敏感，RNA聚合酶和真核细胞的相似，DNA具有内含子并结合组蛋白；此外还具有既不同于原核细胞也不同真核细胞的特征，如：细胞膜中脂类是不可皂化的；细胞壁不含肽聚糖，有的以蛋白质为主，有的含杂多糖，有的类似于肽聚糖，但都不含胞壁酸，D型氨基酸和二氨庚二酸。
区别
于病毒的区别
细菌和病毒同属于微生物，只有在显微镜下才能看到。但两者是截然不同的东西。
病毒是一类个体微小，无完整细胞结构，由蛋白质和核酸组成，必须在活细胞内寄生并复制的非细胞型微生物。
