溯溪是一项危险的户外活动，存在的危险和风险也很大。
首先，危险存在于溪流与深潭中。夏季期间，由于经常有雷阵雨导致溪水暴涨，或是表面平静却富含暗流的深潭，常常使得溯溪者走避不及或遭到暗流卷入。
其次，危险来源于坠落。攀爬瀑布，是溯溪过程中最有趣也最有挑战性的活动，但是，如果遇到非常困难、无法直接攀爬而过的瀑布，就必须爬高绕行而过，而这样的高绕，往往是在无路中开路，也因此有着更多坠落的危险。
再次，危险来自溯溪中的不慎跌倒或滑倒。这是溯溪中最常见的意外伤害。虽然伤害并不是很大，但有时也会因此影响到动作的协调性，而造成再次的跌倒。而个体的技术、平衡感、踏足点的选择，和溯溪鞋的良莠，都是重要的关键因素，而溯行时有时也可能因同伴的疏忽，造成的碰撞而使身体失去平衡而跌倒。
最后，危险来源小伤害。例如，碰到落石，遭遇蚊虫咬伤，被毒蛇咬伤，擦伤、撞伤等，也都是常见的运动伤害。
小提示 制订撤退预案
制定溯溪计划时，要有紧急撤退路线及应变方案的安排，并将全部详细资料备份留给担任留守联络的人员，及约定联络方式。万一发生意外事件时，不可慌乱，一定要视情况的轻重缓急，决定继续前进或撤退中止活动，将伤害减低至最小的程度。
