（3月）15日揭阳附近双方又起剧烈战争，两军死伤各千余人，共三千人。林虎（陈炯明军中猛将）率队将逼近揭阳时，忽被揭阳城外之蒋介石部炮队开快炮猛击，林军死伤枕藉，卒大败而回……然而揭阳附近经两次大战后，已被蹂躏不堪，由揭阳至棉湖、鲤湖等处，沿途六七十里，大小十余村落，已迁徙一空，道上所见者，惟战士之骸骨，联军之死者多已掩埋，而林军因战败，故士卒之尸暴露于野者，尚触目皆是。
而另一篇报道，对东征军（建国军及黄埔学生军）的英勇表现，有更为生动的描写，读其文有如亲临现场：
（3月）18晚4时林（虎）星夜率卫兵逃往石马。19日四城门均被林军链锁，商民异常惊惶。至11点钟闻西门接应残兵入城，城内居民纷纷出城避乱。未及一句钟，而建国军已追踪而至，以是林军据城垣，建国军据河堤及神光山，两军开始攻击。于黄昏黎明时枪声最密。20日下雨如注，建国军围攻，愈迫愈紧，下午三句钟，冒雨冲锋进攻新丰街，异常勇敢，不稍退却。下午7时，攻入兴宁城，林军见势不敌，乃开北门丢弃军物而逃。建国军于晚间8句钟占领全城，一面分兵追截，一面觅驻祠宇。21日县署职员星散，监犯越狱，逃走一空，学生军分队往城乡，搜查散军枪支外，并发传单，演讲三民主义。
这时，孙文逝世的消息传来，东征军哀声动地，蒋介石下令停止前进，扬幡举哀。22日，蒋在前线举行遥祭，并致电胡汉民、廖仲恺、谭延闿，表示愿遵奉孙文遗训，继续从事国民革命工作。
3月21日，由胡汉民、谭延闿、杨希闵、许崇智、刘震寰联名发表通电：
在国民会议未实现，中华民国合法政府未成立以前，所有一切制度设施，汉民等仍谨赓续孙大元帅成规，戮力同心，并期有以发扬光大，以完成国民革命之工作。
得国常于丧，失国常于丧。在中国，政治领袖的去世，往往是政治局势发生剧变的契机。孙文去世后，广东很快便出现暗潮叠涌之势。东江的桂军，纷纷向北江移动，滇军则向广州集结，在白云山麓架起十几门大炮，威胁北郊要隘。滇军总司令杨希闵通知粤军总司令许崇智，所有各军后方留守军队，均须接受滇军检查，前线各军一律不准开回广州，否则缴械。据说滇、桂军内部，已作了权力的安排，杨希闵当总司令，刘震寰当省长。
4月23日，廖仲恺和蒋介石、加伦坐船离开广州，到汕头和许崇智商量应付办法。蒋介石对与滇、桂军开战，信心不足，建议坚守东江，占领闽南，待兵力稍事休整之后，再收复广州。这是当年陈炯明走过的路子。但加伦极力主张保卫广州，不惜与杨、刘一战。
28日，继续开会，围绕“是要广州还是要福建”，进行激烈讨论。许崇智坚决反对攻打广州，认为陈炯明的军队会乘机袭击他们的后路。但廖仲恺已被加伦说服。他也承认，由于孙文逝世，政府在外省籍军队中的影响一落千丈，如果现在不战而退，只就表明政府软弱无能。加伦和廖仲恺都主张，广州作为政治和财政根据地，要不惜一切代价加以坚守。蒋介石犹豫再三，最终也表示同意回师。
5月13日，汪精卫从北京回来，没到广州，先行到汕头。10月13日，全体将领集中汕头，包括汪精卫、廖仲恺、许崇智、蒋介石、加伦，以及湘军、第一军和第三军的参谋长、粤军第三师师长、粤军第一师参谋长，就是否与杨、刘开战，作最后的讨论。最后坚决放弃了进军福建的主张。全军回省，遂成定案。决定由蒋介石担任总指挥，所有进军广州的军队，一律系红领巾为标识，打国民党军旗，取代省旗。5月14日，廖仲恺、汪精卫二人，离开汕头赶回广州。
省城局势，不绝如缕。孙文原是滇桂军的雇主，现在雇主不在了，雇佣军就要造反了。5月25日，桂军总司令刘震寰扬言，桂军将在27日公开行动，反抗政府。5月26日，杨希闵以调人身份，和胡汉民会晤。他先声明自己是拥护政府的，但他不能保证部下和桂军。
胡汉民召集廖仲恺、谭延闿和来自云南的建国第一军军长朱培德等人，在二沙头的颐养园召开紧急会议。胡汉民征求大家意见：“杨、刘问题，到今天已如箭在弦上，不能不谋根本的解决。兄弟于此，已下最大的决心。不知各位的意见如何？”
谭延闿书生出身，喜欢写字吟诗和玩马，处事谨慎，他说：“我相信做这件事，是非常困难的，甚至我的部队敢不敢和杨、刘抗衡，此刻还没有把握。但胡先生的见解，断断不错。在理论上，只有这么做，才能打开革命的道路。”
谭、朱二人都不太愿意与滇军开战。胡汉民的意思，也是倾向于先解决杨希闵，留下刘震寰。但廖仲恺坚决主张一刀切。胡汉民便毅然拍板：“消灭杨、刘，是我们目前必要的工作，杨、刘的力量纵然大，假如我们肯下极大的决心，便无有不行！”
5月底，从北京赶回广州的鲍罗廷，力主克制，不同意与杨、刘即时翻脸，建议再等待数月。胡汉民说，杨、刘问题已达非解决不可的程度，且命令已下，再无商量余地。鲍罗廷断然说：“下了命令也是要收回的。”
他们从晚上9时起，反复争论了几个小时，由宋子文担任翻译。最后胡汉民招架不住了，以睡觉为由挂免战牌，下逐客令。但翌日鲍罗廷还在会上坚持：“6月2号以前，绝不能与杨希闵等决裂，无论如何为难，应保持以前的状态。使军事得圆满进行，是政治当局的责任。”
胡汉民的版本，是鲍罗廷不愿意与滇、桂军开战，但鲍罗廷的版本，却变成是胡汉民不愿开战。他后来在联共（布）中央政治局使团会议上说，胡氏反对与滇、桂军开战，因为，“情况越复杂，胡汉民本人的权力就越巩固。他不关心消灭当时广东的主要主人——滇军和桂军，并把政权交给黄埔新军和粤军许崇智。这场战争几乎是背离胡汉民的意愿进行的。”
他们两人说这些话时，离事情发生的时间并不远，当事人俱在，但已经南阮北阮，各说各话了。真让人感叹，历史到底有多少真相，再也无法大白天下；又有多少假象被永远当成了真相。
6月1日，蒋介石一声令下，东征军返旆西行，回师三多祝。据汪精卫说，这时国民党中央委员会作出了一决议案：
大致说明我们欲整顿中国，必先从整理广东入手；而整顿广东，又必先从整顿军事入手。所以第一要军事统一，第二要民政统一，第三要财政统一、军需独立，第四要各军都受本党政治的训练。这决议案定了之后，大本营总参议代行大元帅职权胡汉民同志立即接受，谭组庵、朱益之（即谭延闿、朱培德）两同志下了实行的决心，再由兄弟（汪精卫）到汕头见许、蒋各同志报告一切，大家都以为这决议案无论如何要尽力使之完全实现，所以6月5日以后，便开始攻击杨刘。③
当此时也，大局风雨飘摇。广州要实行共产的谣言满天飞。为了稳定人心，5月27日，廖仲恺在大本营召开广州商民会议，针对外间流传的“广州共产”谣言，进行辟谣。6月2日，胡汉民以大本营总参议代行大元帅职权兼广东省长名义，发表统一军民财政宣言。这实际上，是一份讨伐杨希闵、刘震寰的檄文。
须知本政府为革命之政府，断无纵容少数佥壬假革命之旗帜，为害民之行为；更不能坐视朝三暮四之军人，阳藉扶翊之名，阴行寇盗之实！
檄文一出，剩下的事情，就在战场上见了。
6月3日，滇军冲进省长公署，大肆捣乱破坏。6月4日，又有一批滇军占据了财政厅。胡汉民把省长公署迁到河南士敏土厂，李福林命令省河军警及各路民团，集中河南，由福军沿江岸戒备，大小兵舰封闭水陆交通孔道，防止滇桂军渡河。
昨天还联名通电，今天便兵戎相见。6月6日下午，滇军在省河和警察枪战。福军在小港的炮兵，向河北密集轰击。8日黎明，滇军乘坐木筏，在海珠河面偷渡，革命军的兵舰突然鼓浪杀出，狭巷短兵相接处，谁的炮火厉害，谁就占据上风。滇军在水中无处可避，被炸得血肉横飞，尸体残肢，随波逐流。
谭延闿从北江南下，蒋介石从东江西进，对广州两边夹击，魏邦平、李福林部从城内接应，布下一个天罗地网阵。6月12日，总攻击开始。枪炮齐发，喊声大震。魏邦平从猎德大举渡河，在石牌与滇军敌住厮杀。蒋介石、何应钦的黄埔校军又从东面杀到，漫山遍野，旌旗蔽日，不知多少军马。滇军向城内溃逃，自相践踏，死伤不计其数。
下午，气势如虹的党军，攻入广州市区，占领观音山。滇军继续向西北逃窜，黄埔学生协助警察维持治安，搜捕散兵游勇。谭延闿的湘军沿粤汉路南下，全歼桂军主力。刘震寰、杨希闵逃往香港。其他军官鸡飞狗跳，纷纷躲进沙面租界。刘震寰后来不知所终；杨希闵一直过着隐居生活，中华人民共和国成立后，应邀为云南省政协委员，1967年病故。
曾经在广州市民面前不可一世的滇、桂军，不到一天时间，便土崩鱼烂，全体星散。
6月14日下午，大本营召开政治会议。出席者有常委胡汉民、汪精卫、廖仲恺、伍朝枢、顾问鲍罗廷等人。胡汉民宣布，叛乱已经敉平，现在是设立国民政府的时候了，所有军队均须将财政、民政、交通等机关交还政府。
大家一致赞成。6月24日，发表《革命政府改组宣言》，公布政府机关的设置为：一、国民政府：分设军事、外交、财政各部；二、军事委员会；三、监察部；四、惩吏院；五、省政府；六、市政委员会。军队一律改称国民革命军。
这是权力洗牌的关键时刻，焦点在于汪精卫、胡汉民身上。孙文死后，胡、汪二人，都把自己视作孙文的天然继承者。以历史与地位而论，二人是叮当马头，但汪氏背后有鲍罗廷撑腰，在比赛中，略胜一个马鼻。政府组织的人选，由常务委员胡汉民、汪精卫、廖仲恺、伍朝枢四人，共同拟定。汪精卫、廖仲恺说要和许崇智、蒋介石商量一下，把名单取走了，几天没有拿回来。这时，报纸上却哄传着另一个版本的政府官员名单。
胡汉民所撰《革命过程中之几件史实》，有如下记载：
过几天开政治会议，我主席。精卫、仲恺交出名单，与当时拟定的不相同，与报纸宣布的却一般无二。我就问精卫、仲恺、鲍罗廷：“政府组织名单，原来已这样定了，我还没有知道，外面却已经宣布了，这是闹的什么玄虚？我不知道可以，但不能在我未知道以前向外宣布。先生死了，我什么事都可以不问，但不能不顾党。我与你们之间，只就历史关系来说，也不该这样相欺。”
说完，仲恺和精卫都脸红没有作声。我等了一会，大家都没有说话，便把笔一掷，跑回休息室里去了。过一会，鲍罗廷入来，他说：“名单原没有定准，只是不小心向外面公布了。他们犯了幼稚病，胡先生还得原谅他们。”
更让胡汉民丢脸的是，他这位堂堂代理大元帅，曾集党政军权于一身，在新政府中，却只担任一个外交部长职务。他并不谙外语，被英国政府讽刺为“未习外国语言文字，不识外交惯例礼节”，搞外交，完全是赶鸭子上架。当汪精卫听说胡汉民竟然愿意履任时，非常惊讶，引为异数。
至此，桌子底下的较劲，逐渐表面化了。7月1日，陆海军大元帅府，正式改组为中华民国国民政府。汪精卫为国民政府主席，胡汉民、汪精卫、廖仲恺、许崇智、谭延闿为常务委员。
根据组织法，国民政府主席由政治会议成员互选产生，其间发生了一个小插曲。互选时发出选票11张，收回选票亦是11张。宣读结果，汪精卫以11票当选。政治会议秘书伍朝枢读票时，甚为诧异，一连读了两遍：“发出选票11张，收回选票11张，选举汪兆铭的11票。”在座的人都相视而笑。显然汪精卫是自己投了自己一票。本来毛遂自荐也没有什么大不了，可是汪曾一再信誓，这辈子都不做官，最后还是抵抗不了权力的诱惑，偷偷自投一票，成了别人的笑柄。
许崇智任军事部长，廖仲恺任财政部长。军事委员会主席为汪精卫，成员包括汪精卫、胡汉民、伍朝枢、廖仲恺、朱培德、谭延闿、许崇智、蒋介石八名委员，蒋介石排在末位。至此，在鲍罗廷的安排下，党政军大权，由胡汉民转移到一代美男汪精卫手中。
廖仲恺一身而兼任国民党中央常委、工人部长、农民部长、国府委员、财政部长、黄埔军校党代表等十几个要职。
在16名国府委员里，没有一位中共党人。邓中夏认为，政府中分成胡汉民、许崇智、汪精卫三派，胡、许两派都是反对中共的，占了三分之二。共产党必须另起炉灶。
