尼奥死了，出乎所有人的意料，尼奥死了。
就在尼奥已经确认了救世主的身份，收获了爱情，营救了墨菲斯，打败了特工，一切似乎都很美满的时候死了。
尼奥躺在椅子上，脖颈被割开，血顺着椅子流淌下来，发出滴答滴答的声音，尼布甲尼撒号上安静的惊人，除了鲜血滴落在地上的声音，没有任何人做任何动作，没有任何人发出一点声音，就好像刚才的emp不仅将整艘尼布甲尼撒号的能源停掉，顺便把船员们一同冻结了一般。
好一会儿，船员们才在墨菲斯的命令下动了起来，船员们开始恢复被破坏的尼布甲尼撒号，只留崔妮蒂在椅子旁抱着尼奥的尸体。
当尼布甲尼撒号上回复能源后，船员们才有机会仔细检查船上的蛛丝马迹，希望可以找出尼奥死亡的真正原因。
最先船员们还以为是赛弗脱离了束缚，和尼奥同归于尽了，不过赛弗仍绑在排气管上动弹不得。随后大家就发现周忱煜不见了。这个时候，无论再怎样难以置信，都只能导出一个结论，那就是周忱煜杀死了尼奥，并用难以理解的方式逃走了。
寻找周忱煜的事船员们尝试一下就放弃了，周忱煜可以在使用emp炸弹的一瞬间杀死尼奥并消失，那么寻找周忱煜的难度就可想而知了，何况现在最重要的事是安葬尼奥，其余都可以押后进行。
“这是什么？”在墨菲斯和崔妮蒂将尼奥从椅子上搬下来时，一个信封掉了下来，落在了墨菲斯的脚边。
坦克拾起这封信，在墨菲斯将尼奥收殓了之后交给了他。“是约翰写的，这上面有他的名字。”
墨菲斯接过信封，盯着信封上的名字好一会，才拆开信封。什么导致了现在的状况，只能通过周忱煜留下的这封信来了解了。
这是一封没有格式的信，看得出来写信的人一定经过了很多的内心挣扎，信上到处都是涂改的痕迹。
墨菲斯默默地读着信，看得出他的心情很不平静，即使是发尼奥死了，他的表情也没有这么复杂，他狠狠的攥着信，手上的青筋暴起。在读完整封信之后，他沉默良久，还是有气无力的把信递给身边的崔妮蒂，对所有人说道：“都看看吧，我无法肯定信中的真假，不过这确实解释了一些事情。我需要静静。”说完墨菲斯就离开了主甲板，回到了自己的舱室。
船员们默默地看着墨菲斯离开，随后所有人都围在崔妮蒂的身边，开始阅读这封充满秘密的信。
“尼布甲尼撒号上的各位，当你们看到这封信时，想必你们已经确认了救世主的身份，而我可能已经消失在船上了。
尼奥现在已经死了，没错是我杀的。很抱歉，墨菲斯、崔妮蒂，但我不得不这么做。你们一定非常想知道原因，请容许我先说明一些别的事情，之后我再说明我这么做的原因。
首先我要说明的一点，我不是矩阵中的人，我来自于一个更高的维度。我来到这里，就像你们进入矩阵一样，所以我会知道一些你们不知道的东西。
接下来我说的，你们肯定会非常难以接受，但我向你们保证这一切都是事实。
你们被先知骗了，我不是说尼奥不是救世主，他的确是救世主。但先知除了这一点之外，都是骗你们的。
在你们的认知中，先知只是一个活了很久，神通广大的人。但其实先知是一个程序，一个极其高级的程序。它指引你们寻找救世主并不是为了人类的解放，而是控制你们按照它的剧本行动。
这里就要提到先知的目的了，先知的目的是寻求矩阵的进化。为此它导演了整个剧本，你们只知道现在是2199年左右，但这个时间也是错的，你们不知道锡安已经毁灭又重建了五次了，这是第六次。
所以矩阵保留人类也不失为了将人类化作电池，而是为了维持矩阵的运转与进化。
矩阵的进化需要人类，当矩阵第一次走到了进化的尽头时，它发现了这一点。于是就有了锡安的建立，和救世主的传说。救世主是矩阵创造的半人半程序，当矩阵需要进化，救世主就会出现，当救世主获得了矩阵进化所需要的特质后，救世主就会回归矩阵，同时锡安就会毁灭。
这次矩阵的进化方向是爱。崔妮蒂，所以先知才会对你说，你爱的人才是救世主，尼奥一直都是救世主，先知不过是需要你爱上他罢了。
现在我可以解释我杀死尼奥的原因了——为了人类的解放！
我杀死了救世主，就是截断了矩阵这次进化的进程，但这并不是说可以击败矩阵了，我其实是给了人类一个同归于尽的机会。
现在，你们可以采取两种行动方式，第一种是将人类的灭亡推迟，但这可以保住矩阵中的人类，可是锡安注定毁灭。
如果选则这种方法，首先你们要进入矩阵，向先知报告尼奥死亡的消息，这里没有任何的监控设施，你们可以说尼奥死于机械乌贼，先知会相信你们的。然后先知会再给你们一个目标，你们会重复解救这个目标的过程，这个目标可能叫艾诺（eno）或诺阿（noe），不论叫什么，先知都会再给你们一个救世主。
这次矩阵可能会换一个进化主题，但是你们会帮助矩阵完成这次进化，这样你们会保证矩阵中的人类的生存——这是人类的大多数，舍弃锡安中的一小部分人。
不过这个办法的弱点非常明显，矩阵终于有一天会进化到不需要人类的成都，这个方法只不过是饮鸩止渴，推迟人类毁灭的时间，或者祈祷锡安在日后的轮回中可以寻找出解决矩阵的方法。不过我对此不抱希望，因为你们很难再碰上像我这样知道一切的高维存在了，矩阵会把它的信息隐藏的非常好，使你们难以得知真相。
至于第二种方法，则是我说的与矩阵同归于尽的机会。
你们从此以后不要让人和一个人进入矩阵，拖延矩阵知道尼奥死亡的消息。这样会为你们争取一些时间，在这段时间，你们要回到矩阵，把整个锡安的居民化整为零，通过气垫船分散开来。通过整个城市下水道和矩阵派出的机械乌贼打游击，拖延到矩阵崩溃的那一刻。
但是绝对不要死守锡安！锡安就是矩阵建立的，你们的一切矩阵都了如指掌，尤其是锡安已经被攻破五次了，不要相信锡安的情报网和防护。
你们会经历一段极其艰难的生活，不会有很多人生存下来。但你们仍要坚持，坚持到矩阵崩溃为止。
这个时候，又有三种可能。我对这种可能不抱什么希望，那就是人类坚持住了，矩阵崩溃了，人类仍有种子保存下来，这些种子会在矩阵的残骸上重建人类文明。
不过，这就要完全舍弃矩阵中的人类，现在地球上的生态圈只能供养少量的人类，没有了矩阵，数量庞大的人类是一定会灭绝的。所以在这种情况下，其实是对矩阵人类进行安乐死，他们的牺牲会化作人类再次崛起的基石。
第二种可能，你们坚持到矩阵崩溃的边缘，但是人类也要坚持不下去了。这个时候，无论谁提出，你们都会经历一场谈判，你们将帮助矩阵进化，矩阵将为你们提供生存所需，人类和矩阵将再次达到共存，这是最好的一种可能，但是要如何保证矩阵不出尔反尔，就是你们的问题了。
最后一种可能，我认为这是可能性最大的一种，锡安没有坚持下来，最终还是被矩阵消灭了。但是矩阵也已经到了崩溃的边缘，这时再想重建锡安也已经来不及了，矩阵会为人类陪葬。
锡安人都是反抗者和反抗者的后代，我认为你们不会不做任何努力就向矩阵妥协，你们会选择第二种行动，希望你们可以坚持到最后。
最后，做个自我介绍吧，我叫周忱煜，很高兴认识你们，感谢你们为了人类生存而战。”
